Resultado da pesquisa (102)
Termo utilizado na pesquisa isolated
#1 - Phylogenetic analysis of Sporothrix brasiliensis isolated from feline sporotrichosis on São Luís Island, Maranhão, Brazil
Abstract in English:
Sporotrichosis is a zoonotic cutaneous mycosis caused by saprophytic fungi of the Sporothrix, affecting cats, horses, dogs, and humans. This study aimed to evaluate sporotrichosis in cats clinically and to phenotypically characterize and molecularly characterize Sporothrix species on São Luís Island, Maranhão, Brazil. From October 2022 to July 2023, clinical assessments and cytological examinations were performed on suspected feline sporotrichosis cases at the Francisco Edilberto Uchôa Lopes Veterinary Hospital, State University of Maranhão. Lesion exudates were collected via exfoliation or imprinting for fungal culture and species identification. Fungal cultures underwent species-specific polymerase chain reaction (PCR), genetic sequencing, and phylogenetic analysis. A total of 46 cats (33 males and 13 females) were assessed. Disseminated cutaneous sporotrichosis was observed in 70% of cases, with lesions predominantly on the face, ears, thoracic regions, and limbs. Initially, white fungal cultures gradually turned blackish with a coriaceous texture characteristic of Sporothrix spp. PCR amplification of the calmodulin (CAL) gene using Sporothrix brasiliensis-specific primers confirmed all 46 samples as S. brasiliensis. Phylogenetic analysis revealed genetic identity rates ranging from 90% to 100% with S. brasiliensis sequences. This seems to be the first molecular confirmation of S. brasiliensis causing feline sporotrichosis on São Luís Island.
Abstract in Portuguese:
A esporotricose é uma micose cutânea zoonótica causada por fungos saprófitas pertencentes ao gênero Sporothrix que acomete gatos, cavalos, cães e humanos. Este estudo teve como objetivo avaliar clinicamente a esporotricose em gatos e caracterizar fenotípica e molecularmente as espécies de Sporothrix sp. na ilha de São Luís, estado do Maranhão, Brasil. De outubro de 2022 a julho de 2023, avaliações clínicas e exames citológicos foram realizados em casos suspeitos de esporotricose felina no Hospital Veterinário Francisco Edilberto Uchôa Lopes, Universidade Estadual do Maranhão. Exsudados de lesões foram coletados por esfoliação ou imprint para cultura fúngica e identificação de espécies. As culturas fúngicas foram submetidas à reação em cadeia em polimerase (RCP) espécie-específica, sequenciamento genético e analise filogenética. Um total de 46 gatos (33 machos e 13 fêmeas) foram avaliados. Esporotricose cutânea disseminada foi observada em 70% dos casos, com lesões predominantemente na face, orelhas, regiões torácicas e membros. Inicialmente, culturas fúngicas brancas gradualmente tornaram-se enegrecidas com uma textura coriácea característica de Sporothrix spp. A amplificação por PCR do gene calmodulina (CAL) usando primers específicos de Sporothrix brasiliensis confirmou todas as 46 amostras como S. brasiliensis. A análise filogenética revelou taxas de identidade genética variando de 90% a 100% com sequências de S. brasiliensis. Esta parece ser a primeira confirmação molecular de S. brasiliensis causando esporotricose felina na Ilha de São Luís.
#2 - Global distribution of antimicrobial resistance in pathogenic Escherichia coli isolated from calves: a systematic review
Abstract in English:
The present study aimed to perform a systematic review to determine the antimicrobial resistance (AMR) profile of pathogenic Escherichia coli strains isolated from the intestinal tract of calves worldwide. Six databases were systematically searched (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus and Web of Science) with no restrictions regarding the year or place of the publications. A total of 932 studies were recovered, and 56 articles, published from 1982 to 2020, were included in this systematic review. These articles were selected based on title, abstract and full text. The most used technique to determine the susceptibility to antimicrobials of E. coli strains was the disk diffusion test (83.93%, 47/56), followed by the minimum inhibitory concentration (MIC) test (19.64%, 11/56). Only two studies (3.57%, 2/56) performed both tests. Seventy-seven different antimicrobial drugs of 17 classes were tested using disk diffusion methodology. For the MIC, fifteen antimicrobial classes and sixty-one antimicrobial drugs were tested. Cephalosporins were the most tested antimicrobial class, both by disk diffusion and MIC methods. Antimicrobial classes with the highest resistance levels were observed for tetracyclines, penicillins, folate inhibitors, aminoglycosides, phenicols and fluoroquinolones. Due to the heterogeneity and low quality of the studies, mainly regarding the antimicrobial susceptibility test methodology used, it was not possible to perform a meta-analysis. The findings showed the global spread of antimicrobial resistance in pathogenic E. coli from calves and indicate the importance of carrying out studies based on well-designed analyses to better understand the real emergence and spread of AMR in this pathogen.
Abstract in Portuguese:
O presente estudo teve como objetivo realizar uma revisão sistemática para determinar o perfil de resistência antimicrobiana (RAM) de cepas patogênicas de Escherichia coli isoladas do trato intestinal de bezerros em todo o mundo. Foram pesquisadas sistematicamente seis bases de dados (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus e Web of Science) sem restrições quanto ao ano ou local das publicações. Foram recuperados 932 estudos, e 56 artigos, publicados entre 1982 e 2020, foram incluídos nesta revisão sistemática. Esses artigos foram selecionados com base no título, resumo e texto completo. A técnica mais utilizada para determinar a suscetibilidade aos antimicrobianos de cepas de E. coli foi o teste de difusão em disco (83,93%, 47/56), seguido pelo teste de concentração inibitória mínima (CIM) (19,64%, 11/56). Apenas dois estudos (3,57%, 2/56) realizaram ambos os testes. Setenta e sete diferentes antimicrobianos de 17 classes foram testados usando a metodologia de difusão em disco. Para o MIC, foram testadas quinze classes antimicrobianas e sessenta e um fármacos antimicrobianos. As cefalosporinas foram a classe antimicrobiana mais testada, tanto pelos métodos de difusão em disco quanto pelo MIC. As classes antimicrobianas com maiores níveis de resistência foram observadas para tetraciclinas, penicilinas, inibidores de folato, aminoglicosídeos, fenicóis e fluoroquinolonas. Devido à heterogeneidade e baixa qualidade dos estudos, principalmente quanto à metodologia de teste de suscetibilidade antimicrobiana utilizada, não foi possível realizar uma meta-análise. Os achados mostraram a disseminação global da resistência antimicrobiana em E. coli patogênica de bezerros e indicam a importância da realização de estudos baseados em análises bem delineadas para melhor compreender a real emergência e disseminação da RAM neste patógeno.
#3 - Fungi isolated from wild birds in the Marambaia Island, Rio de Janeiro State, southeastern Brazil
Abstract in English:
In Brazil, the Atlantic Forest has been suffering from deforestation, which has had impacts on its flora, fauna, and microbiota. However, the fungal diversity present in these environments is little known and studied. In this study, a total of 90 samples of 45 wild birds (45 feathers and 45 feces) were collected in Ilha da Marambaia, southeastern Brazil. Filamentous fungi isolated from these samples were identified through macroscopic and microscopic characteristics. Some isolates were identified by molecular biology using the PCR technique. Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor and Syncephalastrum were identified. These results indicate the presence of saprophytic fungi species in the feathers and feces of wild birds of the capture site. Further studies should be conducted to elucidate if the mycobiota profile modifies with anthropization and if it interferes with bird health and environmental recovery.
Abstract in Portuguese:
No Brasil, a Mata Atlântica vem sofrendo com o desmatamento, que tem impactado sua flora, fauna e microbiota. No entanto, a diversidade fúngica presente nesses ambientes é pouco conhecida e estudada. Neste trabalho, um total de 90 amostras de 45 aves silvestres (45 penas e 45 fezes) foram coletadas na Ilha da Marambaia, Sudeste do Brasil. Fungos filamentosos isolados dessas amostras foram identificados por meio de características macroscópicas e microscópicas. Alguns isolados foram identificados por biologia molecular usando a técnica de PCR. Foram identificados Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor e Syncephalastrum. Esses resultados indicam a presença de espécies de fungos saprofíticos nas penas e fezes de aves silvestres do local de captura. Novos estudos devem ser realizados a fim de elucidar se o perfil da micobiota se modifica com a antropização e se interfere na saúde das aves e na recuperação ambiental.
#4 - Detection of virulence genes, antibiotic resistance genes and antibiotic resistance of Escherichia coli isolated from diarrheic lambs in Anhui Province, China
Abstract in English:
Lamb diarrhea seriously restricts the development of the sheep industry. Infectious pathogens often cause diarrhea, and E. coli isolates are highly distributed in infectious diarrhea. The study aimed to investigate the prevalence of pathogenic E. coli in diarrhea lambs and determine the distribution of virulence genes, antibiotic resistance genes, and antibiotic resistance. One hundred seventy-eight E. coli isolates were isolated from the feces of 204 diarrhea lambs. The virulence genes mdh, hlyF, iss, ompA, fimC, iucD, st, lt, stx1, stx2, and antibiotic resistance genes including tetA, tetB, aac (6′)-II, blaCMY-2, qnr, aadA1, sul1, blaTEM, blaCTX-M were detected by polymerase chain reaction (PCR). Antibiotic resistance was determined by Kirby-Bauer Disc Diffusion method. There were 109 (61.24%, 109/178) enterotoxigenic E. coli (ETEC), 119 (66.85%, 119/178) Shiga toxin-producing E. coli (STEC), and 95 (53.37%, 95/178) hybrid STEC/ETEC isolates. The highest prevalent virulence genes were ompA (80.90%, 144/178) and fimC (67.98%, 121/178), and the lowest was iucD (8.99%, 16/178). The most commonly detected antibiotic resistance genes were tetA/tetB (92.70%, 165/178), qnr (75.84%, 135/178), and sul1 (62.92%, 112/178), no blaTEM or blaCTX-M genes were detected. All isolates had high antibiotic resistance to lincomycin (96.63%, 172/178), tetracycline (88.76%, 158/178), and co-trimoxazole (80.34%, 143/178), and the multidrug resistant (MDR) rate reached 93.82% (167/178). The high prevalence of ETEC and STEC indicates that E. coli is one of the critical pathogenic agents leading to diarrhea in lambs in the region, and its high antibiotic resistance, especially MDR, should be brought to our attention.
Abstract in Portuguese:
Lamb diarrhea seriously restricts the development of the sheep industry. Infectious pathogens often cause diarrhea, and E. coli isolates are highly distributed in infectious diarrhea. The study aimed to investigate the prevalence of pathogenic E. coli in diarrhea lambs and determine the distribution of virulence genes, antibiotic resistance genes, and antibiotic resistance. One hundred seventy-eight E. coli isolates were isolated from the feces of 204 diarrhea lambs. The virulence genes mdh, hlyF, iss, ompA, fimC, iucD, st, lt, stx1, stx2, and antibiotic resistance genes including tetA, tetB, aac (6′)-II, blaCMY-2, qnr, aadA1, sul1, blaTEM, blaCTX-M were detected by polymerase chain reaction (PCR). Antibiotic resistance was determined by Kirby-Bauer Disc Diffusion method. There were 109 (61.24%, 109/178) enterotoxigenic E. coli (ETEC), 119 (66.85%, 119/178) Shiga toxin-producing E. coli (STEC), and 95 (53.37%, 95/178) hybrid STEC/ETEC isolates. The highest prevalent virulence genes were ompA (80.90%, 144/178) and fimC (67.98%, 121/178), and the lowest was iucD (8.99%, 16/178). The most commonly detected antibiotic resistance genes were tetA/tetB (92.70%, 165/178), qnr (75.84%, 135/178), and sul1 (62.92%, 112/178), no blaTEM or blaCTX-M genes were detected. All isolates had high antibiotic resistance to lincomycin (96.63%, 172/178), tetracycline (88.76%, 158/178), and co-trimoxazole (80.34%, 143/178), and the multidrug resistant (MDR) rate reached 93.82% (167/178). The high prevalence of ETEC and STEC indicates that E. coli is one of the critical pathogenic agents leading to diarrhea in lambs in the region, and its high antibiotic resistance, especially MDR, should be brought to our attention.
#5 - Detection of occult metastases of mammary carcinomas in lymph nodes of dogs by immunohistochemistry combined with histochemistry techniques
Abstract in English:
Lymph node status is considered an important clinical prognostic factor in canine mammary carcinomas and women’s breast neoplasms. However, occult isolated tumor cells (ITCs) can be missed during hematoxylin and eosin (HE) analyses. Immunohistochemistry (IHC) for cytokeratin can be used to detect carcinomatous occult ITCs in mammary drainage lymph nodes. However, brown pigments, such as hemosiderin and ceroid in lymph nodes, may hinder the search for occult metastases by IHC utilizing DAB (3,3′-diaminobenzidine) as the chromogen. The aim of this study was to identify ITCs in canine lymph nodes of cases in which it was not detectable by routine HE evaluation through IHC for cytokeratin (AE1/AE3) combined with histochemistry techniques, such as Perls’ Prussian blue and periodic acid-Schiff (PAS), to improve the detection of occult metastases when hemosiderin and ceroid were present in these lymph nodes. For this, 25 tubulopapillary mammary carcinomas with their respective submitted 29 regional lymph nodes, previously given as free of tumor cells by HE analyses, were selected. Mammary tumors were graduated, and vascular invasion was investigated in these tumors. The submitted lymph nodes were reevaluated in HE, looking for occult metastases. IHC for cytokeratin (AE1/AE3) was used to detect occult metastases in mammary lymph nodes. Subsequently, a combined technique of IHC with Perl’s Prussian blue (for hemosiderin) or PAS (for ceroid) was performed to optimize the detection of ITCs by IHC, distinguishing them from pigments. Occult metastases were classified by their microanatomical location in subcapsular, cortical and medullary. Hemosiderin and ceroid were searched in lymph nodes and quantified as low, moderate, or high. The amount of pigments with a percentage of ITCs was also compared. Isolated tumor cells were found in 24.1% (7/29) of mammary lymph nodes. These ITCs were located mainly in subcapsular sinuses (4/7; 57.1%), followed by cortical (2/7; 28.5%) and medullary sinuses (1/7; 14.3%). There were concomitant lymph nodes with ITCs in 33.4% (2/6) of cases with vascular invasion. Hemosiderin and ceroid were present in about 90% of the 29 lymph nodes analyzed. In 42.8% (3/7) of lymph nodes with ITCs, hemosiderin and/or ceroid were in the same location as ITCs. It was found that lymph nodes in which ITCs were detected also present high amounts of hemosiderin (3/7; 42.9%) and low amounts of ceroid (5/7; 71.4%). In this study, IHC for cytokeratin (AE1/AE3) was an efficient method to detect occult tumor cells. IHC combined with Perls’ Prussian blue or with PAS proved to be a helpful way to investigate the presence of occult metastases in the lymph nodes of mammary canine tumors. It allowed distinguishing hemosiderin and ceroid, respectively, from ITCs in the same slide of IHC (immunostained by DAB), favoring a more accurate analysis by pathologists, which can be useful for the oncological staging of these patients.
Abstract in Portuguese:
O status nodal é considerado um importante fator prognóstico clínico em cães com carcinomas mamários e em mulheres com neoplasmas mamários. No entanto, durante a análise histopatológica convencional (coloração de hematoxilina e eosina - HE), células neoplásicas podem permanecer ocultas no linfonodo. Imuno-histoquímica (IHQ) para citoqueratina pode ser utilizada para detectar células carcinomatosas isoladas ocultas em linfonodos de drenagem mamária. Entretanto, a presença de pigmentos marrons, como a hemossiderina e o ceroide em linfonodos, pode dificultar a procura por metástases ocultas durante a análise por IHQ utilizando o DAB (3,3′-diaminobenzidina) como cromógeno. O objetivo deste estudo foi identificar células tumorais isoladas (CTIs), não detectadas pela avaliação de rotina (HE), em linfonodos de cães, através de IHQ para citoqueratina (AE1/AE3) combinada com técnicas histoquímicas, como azul da Prússia e ácido periódico Schiff (PAS), para otimizar a detecção de metástases ocultas, quando os pigmentos hemossiderina e ceroide estavam presentes nos linfonodos. Para esta finalidade, 25 carcinomas mamários túbulo-papilares com seus respectivos 29 linfonodos regionais remetidos, previamente diagnosticados como livres de células neoplásicas pelo HE foram selecionados. Os tumores mamários foram graduados e a presença de invasão vascular foi investigada nestes tumores. Os linfonodos submetidos foram reavaliados histologicamente no HE, à procura de metástases ocultas. IHQ para citoqueratina (AE1/A3) foi utilizada para detectar metástases ocultas nos linfonodos mamários. Subsequentemente, técnicas combinadas de IHQ com azul da Prússia (para hemossiderina) ou PAS (para ceroide) foram realizadas para otimizar a detecção de CTIs através da IHQ, distinguindo-as dos pigmentos. As metástases ocultas foram classificadas pela sua região microanatômica nodal em subcapsular, cortical e medular. Hemossiderina e ceroide foram identificados no linfonodo e classificados de acordo com sua quantidade em baixa, moderada e alta. Também foram comparadas a quantidade de pigmentos com a porcentagem de CTIs. Foram encontradas CTIs em 24,1% (7/29) dos linfonodos mamários. Estas CTIs estavam localizadas principalmente em seios subcapsulares (4/7; 57,1%), seguido pela cortical (2/7; 28,5%) e seios medulares (1/7; 14,3%). Em 33,4% (2/6) dos casos com invasão vascular havia, concomitantemente, linfonodos de drenagem com CTIs. Hemossiderina e ceroide estavam presentes em cerca de 90% dos 29 linfonodos analisados. Em 42,8% (3/7) dos linfonodos com CTIs, hemossiderina e/ou ceroide estavam na mesma localização das CTIs. Os linfonodos que apresentaram CTIs também apresentavam grande quantidade de hemossiderina (3/7; 42,9%) e pequena quantidade de ceroide (5/7; 71,4%). Neste estudo, IHQ para citoqueratina (AE1/AE3) foi um método eficiente para detecção de células tumorais ocultas. A técnica combinada de IHQ com azul da Prússia ou com o ácido periódico de Schiff (PAS) mostrou ser uma maneira útil de investigar a presença de metástases ocultas em linfonodos de cães com tumores mamários caninos, distinguindo a hemossiderina e o ceroide, respectivamente, de CTIs na mesma lâmina de IHQ (imunomarcadas por DAB), favorecendo uma análise mais acurada pelos patologistas, o que pode ser útil no estadiamento oncológico destes pacientes.
#6 - Antimicrobial multiresistance and biofilm formation in Salmonella enterica isolated from broiler production chain
Abstract in English:
Poultry and poultry products are considered the predominant sources of Salmonella enterica contamination and are important reservoirs of bacteria with antimicrobial resistance. The objective of this study was to identify Salmonella with multidrug resistance (MDR) phenotype, with the ability to form biofilms and elucidate the presence of genes that encode antimicrobial resistance in isolates from the broiler production chain in the state of Maranhão, Brazil. A total of 121 strains of S. enterica of different serovars were evaluated for antimicrobial susceptibility, and of these, 26 strains were used to detect the ability to form biofilms and identify resistance genes using PCR. Antimicrobial resistance was observed in 95 (78.5%) Salmonella isolates, and 57 (47.1%) showed MDR phenotype. The isolates showed greater resistance to the sulfonamide principles (58.7%), trimethoprim (48.8%), tetracycline (45.4%), nalidixic acid (44.6%), amoxicillin and ampicillin (26.4%), and cefazolin (22.3%). Salmonella Schwarzengrund (n=21/61.7%), Albany (n=15/62.5%), and Enteritidis (n=4/44.5%) showed the highest indices of MDR phenotype. The ability to form biofilms at 37°C was found in 13 of the 26 strains evaluated, which were considered poor producers. The resistance genes blaCTX-M, blaCTX-M2, blaSHV, sul1, sul2, tetA, tetB, tetC, tetE, dfrA12, and dfrA1 were observed in the serovars Schwarzengrund, Albany, Enteritidis, Heidelberg, and Typhimurium. The results showed a high occurrence of S. enterica, with multiple resistance to conventional antimicrobials and the ability to form biofilms in the poultry production chain.
Abstract in Portuguese:
As aves e os produtos de origem aviária são fontes de contaminação predominantes de Salmonella enterica e importantes reservatórios de bactérias com resistência antimicrobiana. Objetivou-se identificar Salmonella com fenótipos de multirresistência a drogas (MDR), com a capacidade de formação de biofilmes e a presença de genes que codificam resistência antimicrobiana em isolados da cadeia de frangos de corte, do estado Maranhão, Brasil. Avaliaram-se 121 cepas de S. enterica de sorovares diferentes quanto ao teste de suscetibilidade aos antimicrobianos e destas, 26 cepas para detecção da capacidade de formar biofilmes e genes de resistência pela técnica de PCR. Foram encontradas resistência antimicrobiana em 95 (78,5%) dos isolados de Salmonella e 57 (47,1%) apresentaram fenótipos MDR. Os isolados apresentaram maior resistência aos princípios sulfonamida (58,7%), trimetoprim (48,8%), tetraciclina (45,4%), ácido nalidíxico (44,6%), amoxicilina e ampicilina (26,4%) e cefazolin (22,3%). Os sorovares Salmonella Schwarzengrund (n=21/61.7%), Albany (n=15/62.5%) e Enteritidis (n=4/44.5%) apresentaram os maiores índices de fenótipos MDR. A capacidade de formar biofilmes foi encontrada em 13 cepas avaliadas, consideradas fracamente produtoras. Nos sorovares S. Schwarzengrund, Albany, Enteritidis, Heidelberg e Typhimurium foram detectados os genes de resistência blaCTX-M, blaCTX-M2, blaSHV, sul1, sul2, tetA, tetB, tetC, tetE, dfrA12 e dfrA1. Os resultados evidenciaram a elevada ocorrência de fenótipos de S. enterica com resistência múltipla a antimicrobianos convencionais, com capacidade de formar biofilmes, na cadeia produtiva de aves destinadas ao consumo humano.
#7 - Listeria innocua and serotypes of Listeria monocytogenes isolated from clinical cases in small ruminants in the northwest of Uruguay
Abstract in English:
Listeriosis is an infectious disease caused by bacteria of the genus Listeria, the neurological form being more common in ruminants. There are many reports of listeriosis in small ruminants in the region that includes Brazil, Argentina and Uruguay. However, these diagnoses were mainly based on histological lesions in the central nervous system (CNS) without the isolation and characterization of the involved Listeria strains. The aim of this study was to report sheep and goats listeriosis cases from 2016 to 2021 in northwestern Uruguay. The diagnosis was made according to lesions observed at histopathology, plus Listeria isolation in CNS, identifying it at specie and serotype level. Nine animals (n=9) of three outbreaks and five sporadic cases of listeriosis were studied. Sheep was the species with more cases in relation to goats, and adults were the category most affected. Cases occurred in spring and less frequently in winter. All presented neurological clinical signs and the lesions in the CNS were consistent with suppurative meningoencephalitis and micro-abscesses in the brainstem. In eight of nine CNS samples, Listeria strains were isolated (seven L. monocytogenes and one L. innocua). All the L. monocytogenes isolates carried the inlA gene; serotyping showed that four strains belonged to serotype 1/2b, two isolates belonged to serotype 4b, and one to serotype 1/2a. Considering that listeriosis is a common disease in this region and the fact that isolates are scarcely recovered from small ruminants, it would be important to emphasize the need for Listeria isolation to better characterize the strains that affect animals. Not only to improve knowledge about the epidemiology of disease but also with the objective of developing serotype specific vaccines for animal use.
Abstract in Portuguese:
Listeriose uma doença bacteriana causada pelo gênero Listeria, a forma nervosa é a mais comum em ruminantes. No Brasil, Argentina e Uruguai há vários relatos de listeriose em pequenos ruminantes com diagnóstico baseado na histopatologia do sistema nervoso central (SNC), sem o isolamento e a caracterização do agente. O objetivo deste trabalho foi relatar uma série de casos diagnosticados em ovinos e caprinos no período 2016-2021 no noroeste do Uruguai. O diagnóstico foi feito basado nas lesões observadas na histopatologia, e caracterização das cepas de Listeria recuperadas do SNC quanto à espécie e sorotipo. Nove animais (n=9) do três surtos e cinco casos isolados de listeriose foram estudados. Os ovinos foram a espécie com o maior número de casos em relação aos caprinos, sendo os animais adultos a categoria mais afetada em ambas espécies. A doença ocorreu principalmente na primavera com alguns casos observados no inverno. Todos os casos apresentavam sinais clínicos nervosos e as lesões no SNC caracterizavam-se por meningoencefalite supurativa com presença de microabscessos no tronco encefálico. Em oito de nove amostras do SNC foram isoladas cepas de Listeria (sete L. monocytogenes e uma L. innocua). Todos os isolados de L. monocytogenes continham o gene inlA; a sorotipagem apresentou quatro cepas do serotipo 1/2b, duas cepas serotipo 4b e uma cepa 1/2a. Levando em consideração que nesta região a listeriose é uma doença frequente e que existem poucos isolados recuperados de casos clínicos em pequeño ruminantes, torna-se relevante o isolamento deste agente para caracterização das cepas que afetam os animais. Não só para melhorar o conhecimento sobre a epidemiologia da doença, mas também com o objetivo de desenvolver vacinas sorotipo-especificas para uso animal.
#8 - Genomic characterization, antimicrobial resistance profiles, enterotoxin, and biofilm production of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from clinical and animal products origins in Eastern Turkey
Abstract in English:
Staphylococcus aureus is an opportunistic and ubiquitous pathogen found in the skin, nares, and mucosal membranes of mammals. Increasing resistance to antimicrobials including methicillin has become an important public concern. One hundred and eight (108) S. aureus strains isolated from a total of 572 clinical and animal products samples, were investigated for their biofilm capability, methicillin resistance, enterotoxin genes, and genetic diversity. Although only one strain isolated from raw retail was found as a strong biofilm producer, the percentage of antimicrobial resistance pattern was relatively higher. 17.59% of S. aureus strains tested in this study were resistant to cefoxitin and identified as methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolates. mecA and mecC harboring S. aureus strains were detected at a rate of 2.79% and 0.93%, respectively. In addition, staphylococcal enterotoxin genes including Sea, Seb, Sec, and Sed genes were found to be 18.5%, 32.4%, 6.5% and 3.7%, respectively. The phylogenetic relationship among the isolates showed relationship between joint calf and cow milk isolates. Multi locus sequence typing (MLST) revealed three different sequence types (STs) including ST84, ST829, and ST6238. These findings highlight the development and spread of MRSA strains with zoonotic potential in animals and the food chain throughout the world.
Abstract in Portuguese:
Staphylococcus aureus é um patógeno dúctil e ubíquo encontrado na pele, narinas e membranas mucosas de mamíferos. O aumento da resistência aos antimicrobianos, incluindo a meticilina, tornou-se uma importante preocupação pública. Cento e oito (108) cepas de S. aureus isoladas de um total de 572 amostras clínicas e de produtos animais foram investigadas por sua capacidade de biofilme, resistência à meticilina, genes de enterotoxinas e diversidade genética. Embora apenas uma cepa isolada do cru tenha sido encontrada como forte produtora de biofilme, a porcentagem do padrão de resistência antimicrobiana foi relativamente maior. Parte das cepas (17,59%) de S. aureus testadas neste estudo eram resistentes à cefoxitina e identificadas como isolados de MRSA. mecA e mecC abrigando cepas de S. aureus foram detectados a uma taxa de 2,79% e 0,93%, respectivamente. Além disso, verificou-se que os genes da enterotoxina estafilocócica, incluindo os genes Sea, Seb, Sec e Sed, eram 18,5%, 32,4%, 6,5% e 3,7%, respectivamente. A relação filogenética entre os isolados mostrou relação entre os isolados de bezerro e leite de vaca. A tipagem de sequência multiloco (MLST) revelou três tipos de sequência diferentes (STs), incluindo ST84, ST829 e ST6238. Essas descobertas destacam o desenvolvimento e a disseminação de cepas de MRSA com potencial zoonótico em animais e na cadeia alimentar em todo o mundo.
#9 - Efficacy of disinfectants to inactivate H1N1 influenza A virus isolated from pigs
Abstract in English:
The aim of this study was to access the efficacy of four disinfectants to inactivate influenza A [H1N1] 0 hour and 72 hours after disinfectant dilution. A pandemic H1N1 influenza virus isolated from a pig with respiratory disease was used to obtain inoculums containing 6.4log10 EID50/mL; 5.4log10 EID50/mL; 4.4log10 EID50/mL and 3.4log10 EID50/mL. Suspension test was composed of 400µL of viral inoculum, 100µL of organic load and 500µL of each individually diluted disinfectant and incubated for ten minutes of contact time. After a neutralizing step, each mixture was filtered on a 0.22µm membrane and 0.2mL was inoculated in six 9-day-old embryo chicken egg through allantoic route. The allantoic fluid from eggs was harvest for RT-PCR and hemagglutination test. The experiment was repeated 72 hours after disinfectant dilution. On the first assessment with fresh disinfectant, influenza virus was inactivated by oxidizing compost disinfectant and phenolic disinfectant in all virus concentrations, the quaternary ammonium compound (QAC) and glutaraldehyde association inactivated the virus up to a concentration of 5.4log10 EID50/mL. QAC disinfectant did not eliminate virus viability. Seventy-two hours after disinfectants were diluted, oxidizing compost disinfectant and QAC and glutaraldehyde association disinfectant demonstrated the same result as the evaluation with fresh disinfectant solution. Phenolic disinfectant inactivated viral inoculum up to a concentration of 5.4log10 EID50/mL. QAC had no effect on inactivating 3.4log10 EID50/mL of influenza virus. In conclusion, three of the four disinfectants tested were effective to inactivate pandemic H1N1 influenza virus in the presence of organic load. Test result performed 72hours after disinfectant dilution suggest a decrease in the effectiveness of one disinfectant.
Abstract in Portuguese:
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficácia de quatro desinfetantes em inativar o vírus da influenza A [H1N1] 0-hora e 72-horas após a diluição dos produtos. Um vírus H1N1 pandêmico isolado previamente de um suíno com doença respiratória foi utilizado e foram obtidas quatro concentrações de inóculo contendo 6,4log10 EID50/mL; 5,4log10 EID50/mL; 4,4log10 EID50/mL and 3,4log10 EID50/mL. Para compor o teste em suspensão foram adicionados 400µL de inóculo viral, 100µL de matéria orgânica e 500µL de cada desinfetante diluído individualmente e a mesma foi incubada por 10 minutos. Após a etapa neutralizante, a suspensão foi filtrada em membrana 0,22µm e 0,2mL foi inoculado em seis ovos de galinha embrionados de nove dias de incubação, via rota alantóide. O fluido alantóide foi colhido após 72 horas para testes de hemaglutinação e RT-PCR. O mesmo protocolo experimental foi repetido usando as soluções desinfetantes 72 horas após a diluição. O vírus da influenza foi inativado pelo composto oxidante e também pelo desinfetante fenólico em todas as concentrações virais testadas 0-hora após diluição. O desinfetante com associação de amônia quaternária e glutaraldeído inativou o vírus na concentração de até 5,4log10 EID50/mL. O desinfetante à base de amônia quaternária não inativou o vírus. Os resultados 72-horas após a diluição não diferiram quando comparado com 0-hora, exceto o desinfetante fenólico, o qual inativou o vírus da influenza somente até a concentração 5,4log10 EID50/mL. Concluindo, três dos quatro desinfetantes testados foram efetivos ao inativar o vírus da influenza [H1N1] pandêmico na presença de matéria orgânica. Os resultados do teste com produtos diluídos após 72 horas sugerem redução da efetividade em, pelo menos, um desinfetante.
#10 - Antimicrobial susceptibility profile of enterobacteria isolated from wild grey-breasted parakeets (Pyrrhura griseipectus)
Abstract in English:
The grey-breasted parakeet (Pyrrhura griseipectus) is an endangered psittacine species that have been affected by illegal trade and deforestation. Currently, this endemic species is only found in three areas in Ceará state, in Brazil. This study aimed to investigate the frequency and diversity of Enterobacteriaceae in wild adult grey-breasted parakeets and determine their susceptibility to antimicrobial agents. Cloacal swab samples were collected from 27 individuals and environmental swabs (drag swabs) from five nests used by these birds. Twenty-seven strains from nine species of Enterobacteriaceae were recovered from cloacal swabs, and the most prevalent bacteria strains were Hafnia alvei (22%) and Pantoea agglomerans (22%). From environmental nest samples, seven strains from three bacterial species were isolated, being the P. agglomerans the most frequent species (100%). Twenty-two of the 27 isolates (81.4%) exhibited antibiotic resistance, varying from one to eight of the 12 antimicrobials commonly used. Resistance to amoxicillin was the most prevalent (70.4%), followed by azithromycin (22.2%) and ceftriaxone (18.5%). None of the strains were resistant to gentamicin, tobramycin, ciprofloxacin or tetracycline. The H. alvei was the main species presenting multidrug resistance, including resistance against meropenem, which is an important finding. These results could provide interesting information on the health of these endangered wild grey-breasted parakeets. They could also indicate that the obtained isolates are part of a group of bacteria that are typical components of the enteric microbiota of birds, which present elevated rates of resistance to amoxicillin.
Abstract in Portuguese:
O periquito-de-cara-suja (Pyrrhura griseipectus) é uma espécie de psitacídeo considerado pela IUCN como ameaçado de extinção, resultado do comércio ilegal e do desmatamento. Atualmente, essa espécie endêmica é encontrada apenas em três áreas no estado do Ceará, Brasil. O objetivo deste estudo foi investigar a frequência e a diversidade de Enterobacteriaceae em periquitos de peito cinza adultos selvagens e determinar sua suscetibilidade a agentes antimicrobianos. Amostras de suabes cloacais foram coletadas de 27 indivíduos e de suabes ambientais (suabes de arrasto) de cinco ninhos utilizados por essas aves. Vinte e sete cepas de nove espécies de Enterobacteriaceae foram isoladas a partir de suabes cloacais, sendo as cepas bacterianas mais prevalentes Hafnia alvei (22%) e Pantoea agglomerans (22%). Das amostras ambientais de ninhos foram isoladas sete linhagens de três espécies bacterianas, sendo P. agglomerans a espécie mais frequente (100%). Vinte e dois dos 27 isolados (81,4%) exibiram resistência a antibióticos, variando de um a oito dos 12 antimicrobianos comumente usados. A resistência a amoxicilina foi a mais prevalente (70,4%), seguida por azitromicina (22,2%) e ceftriaxona (18,5%). Nenhuma das cepas era resistente à gentamicina, tobramicina, ciprofloxacina ou tetraciclina. H. alvei foi a principal espécie que apresentou resistência a múltiplas drogas e que também esteve associada a um outro achado relevante desta pesquisa, que foi a detecção de um caso de resistência ao meropenem. Esses dados fornecem informações relevantes sobre a saúde desses periquitos selvagens ameaçados e permite concluir que os isolados obtidos fazem parte de um grupo de bactérias que normalmente compõe a microbiota entérica das aves, sendo a amoxicilina envolvida em elevadas taxas de resistência.
