Resultado da pesquisa (37)
Termo utilizado na pesquisa genética
#1 - Insights into Staphylococcus aureus pathogenesis and genetic diversity in bovine mastitis
Abstract in English:
Bovine mastitis is the most common infectious disease in dairy herds and causes important economic losses. Various pathogens can cause the disease, with Staphylococcus aureus being one of the most significant. S. aureus can cause clinical, subclinical, and chronic forms of the disease due to a variety of virulence factors, including protein A, coagulase, toxins, and adhesins. The presence of methicillin-resistant S. aureus strains complicates treatment protocols and raises concerns about antimicrobial resistance. The genetic characterization of these strains, utilizing techniques such as molecular typing by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), reveals the existence of different genetic and virulence profiles, as well as the geographical variations in the distribution of these genotypes. The role of next-generation sequencing (NGS) technologies, functional genomics, and multi-omics approaches in the genetic research of bovine mastitis are highlighted, providing a complete understanding of its genetic basis and opening opportunities for targeted interventions and improved disease control strategies in the dairy industry. This review highlights the importance of understanding the genetic diversity and pathogenic mechanisms of S. aureus in bovine mastitis to develop effective disease management strategies and reduce economic losses in the dairy sector globally.
Abstract in Portuguese:
A mastite bovina é a doença infecciosa mais comum em rebanhos leiteiros e causa importantes perdas econômicas. Diversos patógenos podem causar a doença, sendo Staphylococcus aureus um dos mais significativos. S. aureus pode causar formas clínicas, subclínicas e crônicas da doença devido a uma variedade de fatores de virulência, incluindo proteína A, coagulase, toxinas e adesinas. A presença de cepas de S. aureus resistentes à meticilina complica os protocolos de tratamento e levanta preocupações sobre a resistência antimicrobiana. A caracterização genética dessas cepas, utilizando técnicas como a tipagem molecular por eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE), revela a existência de diferentes perfis genéticos e de virulência, bem como as variações geográficas na distribuição desses genótipos. Destaca-se o papel das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS), da genômica funcional e das abordagens multi-ômicas na pesquisa genética da mastite bovina, proporcionando uma compreensão mais completa de sua base genética e abrindo oportunidades para intervenções direcionadas e melhores estratégias de controle da doença na indústria de laticínios. Esta revisão destaca a importância de compreender a diversidade genética e os mecanismos patogênicos de S. aureus na mastite bovina para desenvolver estratégias eficazes de manejo da doença e reduzir as perdas econômicas no setor de laticínios globalmente.
#2 - Phylogenetic analysis of Sporothrix brasiliensis isolated from feline sporotrichosis on São Luís Island, Maranhão, Brazil
Abstract in English:
Sporotrichosis is a zoonotic cutaneous mycosis caused by saprophytic fungi of the Sporothrix, affecting cats, horses, dogs, and humans. This study aimed to evaluate sporotrichosis in cats clinically and to phenotypically characterize and molecularly characterize Sporothrix species on São Luís Island, Maranhão, Brazil. From October 2022 to July 2023, clinical assessments and cytological examinations were performed on suspected feline sporotrichosis cases at the Francisco Edilberto Uchôa Lopes Veterinary Hospital, State University of Maranhão. Lesion exudates were collected via exfoliation or imprinting for fungal culture and species identification. Fungal cultures underwent species-specific polymerase chain reaction (PCR), genetic sequencing, and phylogenetic analysis. A total of 46 cats (33 males and 13 females) were assessed. Disseminated cutaneous sporotrichosis was observed in 70% of cases, with lesions predominantly on the face, ears, thoracic regions, and limbs. Initially, white fungal cultures gradually turned blackish with a coriaceous texture characteristic of Sporothrix spp. PCR amplification of the calmodulin (CAL) gene using Sporothrix brasiliensis-specific primers confirmed all 46 samples as S. brasiliensis. Phylogenetic analysis revealed genetic identity rates ranging from 90% to 100% with S. brasiliensis sequences. This seems to be the first molecular confirmation of S. brasiliensis causing feline sporotrichosis on São Luís Island.
Abstract in Portuguese:
A esporotricose é uma micose cutânea zoonótica causada por fungos saprófitas pertencentes ao gênero Sporothrix que acomete gatos, cavalos, cães e humanos. Este estudo teve como objetivo avaliar clinicamente a esporotricose em gatos e caracterizar fenotípica e molecularmente as espécies de Sporothrix sp. na ilha de São Luís, estado do Maranhão, Brasil. De outubro de 2022 a julho de 2023, avaliações clínicas e exames citológicos foram realizados em casos suspeitos de esporotricose felina no Hospital Veterinário Francisco Edilberto Uchôa Lopes, Universidade Estadual do Maranhão. Exsudados de lesões foram coletados por esfoliação ou imprint para cultura fúngica e identificação de espécies. As culturas fúngicas foram submetidas à reação em cadeia em polimerase (RCP) espécie-específica, sequenciamento genético e analise filogenética. Um total de 46 gatos (33 machos e 13 fêmeas) foram avaliados. Esporotricose cutânea disseminada foi observada em 70% dos casos, com lesões predominantemente na face, orelhas, regiões torácicas e membros. Inicialmente, culturas fúngicas brancas gradualmente tornaram-se enegrecidas com uma textura coriácea característica de Sporothrix spp. A amplificação por PCR do gene calmodulina (CAL) usando primers específicos de Sporothrix brasiliensis confirmou todas as 46 amostras como S. brasiliensis. A análise filogenética revelou taxas de identidade genética variando de 90% a 100% com sequências de S. brasiliensis. Esta parece ser a primeira confirmação molecular de S. brasiliensis causando esporotricose felina na Ilha de São Luís.
#3 - Unveiling Trypanosoma spp. diversity in cattle from the state of Rio de Janeiro: A genetic perspective
Abstract in English:
Cattle trypanosomiasis imposes significant economic burdens on the global livestock industry. The causative agents of this disease belong to the protozoan Trypanosoma genus. This study aims to perform detection (parasitological and molecular) and genetic characterization to analyze Trypanosoma spp. in cattle from 15 municipalities in the state of Rio de Janeiro, focusing on the 18S rDNA and Cathepsin-L (CatL) gene of Trypanosoma vivax and Trypanosoma theileri. A total of 389 blood samples from 15 dairy cattle farms in the state of Rio de Janeiro were collected, and DNA was extracted for subsequent PCR amplification of Trypanosoma spp. 18S rDNA and CatL genes. The resulting amplicons underwent sequencing and alignment for phylogenetic analysis, with comparisons made to GenBank isolates. Concerning parasitological analysis, blood smears presented 4.4% of positive cattle (n=17/389) for T. vivax and did not show any trypomastigote forms of T. theileri. The absolute frequency of Trypanosoma spp. through molecular detection targeting 18S rDNA was 11.6% (45/389). However, when performing species-specific PCRs, the T. vivax frequency, determined through CatL gene PCR, was 12.8%, and the T. theileri frequency was 3.6%. Phylogenetic analysis based on 18S rDNA revealed low diversity among T. vivax sequences, suggesting potential host segregation. This study emphasizes the high frequency of positive samples by PCR when compared to direct parasitological exams. Additionally, T. vivax phylogeny targeting 18S rDNA hints at sequence clustering related to host species. Importantly, this investigation unveils, for the first time in Rio de Janeiro’s cattle, the circulation of T. theileri lineage ThI, encompassing genotypes IIB and IF. This discovery expands our understanding of this parasite’s geographical distribution and genetic diversity.
Abstract in Portuguese:
A tripanossomíase bovina impõe significativos ônus econômicos à indústria pecuária global. Os agentes causadores dessa doença pertencem a protozoários do gênero Trypanosoma. Objetivou-se, com este estudo, realizar detecção (parasitológica e molecular) e caracterização genética de Trypanosoma spp. em bovinos de 15 municipalidades do estado do Rio de Janeiro, com foco na sequência 18S rDNA e no gene Cathepsin-L (CatL) de Trypanosoma vivax e Trypanosoma theileri. Um total de 389 amostras de sangue de 15 fazendas leiteiras no estado do Rio de Janeiro foram coletadas, e o DNA foi extraído para subsequente amplificação por PCR dos genes 18S rDNA e CatL de Trypanosoma spp. Os amplicons resultantes foram submetidos a sequenciamento e alinhamento para análise filogenética, com comparações realizadas com isolados do GenBank. No que se refere à análise parasitológica, os esfregaços de sangue apresentaram 4,4% de bovinos positivos (n=17/389) para T. vivax e não mostraram nenhuma forma tripomastigota de T. theileri. A frequência absoluta de Trypanosoma spp. através da detecção molecular visando 18S rDNA foi de 11,6% (45/389). No entanto, ao realizar PCRs específicos de espécies, a frequência de T. vivax, determinada por PCR do gene CatL foi de 12,8%, e a frequência de T. theileri foi de 3,6%. A análise filogenética com base no 18S rDNA revelou baixa diversidade entre as sequências de T. vivax, sugerindo uma possível segregação de hospedeiros. Este estudo enfatiza a alta frequência de amostra positiva pela PCR quando comparada com a parasitológica direta. Além disso, a filogenia de T. vivax direcionada ao 18S rDNA sugere agrupamento de sequências relacionado à espécie hospedeira. Importante destacar que esta investigação revela, pela primeira vez no gado do Rio de Janeiro, a circulação da linhagem ThI de T. theileri, abrangendo os genótipos IIB e IF. Esta descoberta amplia nosso entendimento sobre a distribuição geográfica e diversidade genética desse parasito.
#4 - Genetic diversity of Anaplasma marginale in calves under natural transmission conditions in the Northeast region of Pará
Abstract in English:
The objective of the present study was to detect the genetic diversity of Anaplasma marginale strains in naturally infected calves from a rural property located in the northeastern region of the state of Pará, Eastern Amazon, which has a history of mortality due to anaplasmosis. Fourteen calves positive for A. marginale were selected using a semi-nested polymerase chain reaction for the target msp1α gene, with asymptomatic (n=3) and symptomatic (n=11) infections. After sequencing the samples, two genotypes were verified in the E and C regions and the structures in tandem repeats were determined. Nine different strains were found: eight related to the E genotype (α-β-β-Γ = one animal, asymptomatic; 16-F-17-F-F = two animals, symptomatic; α-β-F-F-F-F = one animal, asymptomatic; 31-62-62-61 = one animal, symptomatic; τ-10-3 = three animals, two symptomatic and one asymptomatic; α-β-β-β = one animal, symptomatic; τ-22 -13-18 = two animals, both symptomatic; β-β-β-BRA1-31 = two animals, both symptomatic), and one related to genotype C (23-24-25-31-27-27 = one animal, asymptomatic). Genotype E was predominant in 92.86% of the samples (13/14), followed by genotype C (7.14%). This study made it possible to detect the genetic diversity of A. marginale in calves from the selected dairy farm, in addition to identifying the BRA1 sequence in the animals of the present study, which was recently diagnosed in Minas Gerais, demonstrating the dispersion of A. marginale strains in herds from different Brazilian states. Genetic diversity of A. marginale was observed in both symptomatic and asymptomatic calves. There were no significant differences when clinical signs were compared to the genotype verified in the infected animals. The prevalence of pathogenicity was not observed.
Abstract in Portuguese:
O objetivo do presente trabalho foi detectar a diversidade genética de cepas de Anaplasma marginale em bezerros naturalmente infectados oriundos de uma propriedade rural localizada na região nordeste do estado do Pará, Amazônia Oriental, a qual apresentava histórico de mortalidade devido à anaplasmose. Foram selecionados 14 bezerros positivos para A. marginale pela técnica de semi-nested PCR (nPCR) para o alvo no gene msp1α, com infecção assintomática (n=3) e sintomáticos (n=11). Após o sequenciamento das amostras foram verificados dois genótipos nas regiões E e C, e determinadas as estruturas em tandem repeats. Nove diferentes estirpes foram encontradas, sendo oito relacionadas ao genótipo E (α-β-β-Γ = um animal, assintomático; 16-F-17-F-F = dois animais, sintomáticos; α-β-F-F-F-F = um animal, assintomático; 31-62-62-61 = um animal, sintomático; τ-10-3 = três animais, dois sintomáticos e um assintomático; α-β-β-β = um animal, sintomático; τ-22-13-18 = dois animais, sintomáticos; β-β-β-BRA1-31 = dois animais, sintomáticos) e uma relacionada ao genótipo C (23-24-25-31-27-27 = um animal, assintomático). O genótipo E foi predominante em 92,86% das amostras (13/14), seguido pelo genótipo C (7,14%). O estudo possibilitou a detecção da diversidade genética de A. marginale em bezerros dessa propriedade leiteira, além de identificar a sequência BRA1 nos animais do presente estudo, a qual foi diagnosticada recentemente em Minas Gerais, o que demonstra a dispersão das estirpes de A. marginale nos rebanhos de diferentes estados brasileiros. A diversidade genética de A. marginale foi observada tanto em bezerros sintomáticos quanto em assintomáticos e não houve diferença significativa quando se comparou os sinais clínicos ao genótipo verificado no animal infectado, não observando a prevalência de patogenicidade de estirpes.
#5 - Detection and genotyping of Giardia duodenalis infecting pigs and small ruminants in the state of Piauí, northeastern Brazil
Abstract in English:
This study performed a molecular detection and characterization of Giardia duodenalis infecting pigs, goats and sheep in rural and peri-urban communities in the state of Piauí, northeastern Brazil, and proposed phylogenetic relationships among the characterized parasites. We assessed 52 fecal samples from pigs, 13 from goats, and 10 from sheep. A fragment of the β-giardin locus was PCR-amplified and sequenced. Overall, PCR-based G. duodenalis positivity was 11/52 (21.2%) in pigs, 2/13 (15.4%) in goats, and 2/10 (20%) in sheep. Seven out of 15 successfully amplified samples could be sequenced: three from pigs, two from goats, and two from sheep. Parasites from different hosts were found to belong to sub-assemblage AII. The phylogenetic analyses of the original G. duodenalis AII β-giardin sequences obtained from distinct host species and sequences of G. duodenalis recovered from humans available in GenBank suggest that the parasites are genetically related, supporting a local scenario of cross-host transmission.
Abstract in Portuguese:
Este estudo teve como objetivo detectar e caracterizar geneticamente amostras de Giardia duodenalis recuperadas de suínos, caprinos e ovinos em comunidades rurais do estado do Piauí, no nordeste do Brasil, propondo relações filogenéticas entre os parasitas caracterizados. Foram estudadas 52 amostras fecais de suínos, 13 de caprinos e 10 de ovinos. Uma região (560 pb) do lócus codificante da β-giardina foi amplificada por PCR e submetida a sequenciamento nucleotídico. A positividade para G. duodenalis pela PCR foi 11/52 (21,2%) em suínos, 2/13 (15,4%) em caprinos e 2/10 (20%) em ovinos. De 15 amostras amplificadas, sete puderam ser sequenciadas: três obtidas de suínos, dois de caprinos e dois de ovinos. Todas foram caracterizadas como pertencentes à subassemblage AII. Análises filogenéticas de amostras de G. duodenalis AII identificadas em diferentes hospedeiros, incluindo sequências de parasitas recuperadas de humanos e obtidas no GenBank, sugerem que os isolados têm alto grau de homologia. Os resultados apontam para um cenário de transmissão cruzada entre diferentes espécies de hospedeiros.
#6 - Detection of feline panleukopenia virus (Carnivore protoparvovirus 1) in free-ranging Panthera onca in Brazil
Abstract in English:
The decline in the jaguar population confirms how much the species is vulnerable to extinction in Brazil. It also indicates the degradation of its natural habitat’s environmental integrity and quality. Studies claim that large felids are susceptible to feline panleukopenia virus (FPV) and are presumptively diagnosed clinically in Brazil. A free-living jaguar (Panthera onca) cub was found unconscious and rescued due to a possible hit-and-run in the savannah of Mato Grosso. During recovery, it exhibited clinical and hematological signs consistent with FPV infection. The PCR was positive for FPV, with 99.61% identity between the FPV sequences available in the GenBank database through the BLAST tool. Due to habitat restrictions, certain diseases threaten wild cats and habitat encroachment by domestic animals can alter the pattern of spread of pathogens. We highlight the importance of the molecular diagnosis and phylogenetic analysis of FPV to elucidate how it has reached wild felids.
Abstract in Portuguese:
O declínio da população de onça-pintada confirma o quanto a espécie está vulnerável à extinção no Brasil, indicando também a degradação da integridade ambiental e da qualidade de seu habitat natural. Estudos afirmam que felinos de grande porte são suscetíveis ao vírus da panleucopenia felina (FPV) e são diagnosticados clinicamente de forma presuntiva no Brasil. Um filhote de onça-pintada (Panthera onca) de vida livre foi encontrado inconsciente e resgatado devido a um possível atropelamento no cerrado do Mato Grosso. Durante a recuperação, apresentou sinais clínicos e hematológicos compatíveis com infecção por FPV. A PCR foi positiva para FPV, com 99,61% de identidade entre as sequências de FPV disponíveis no banco de dados GenBank por meio da ferramenta BLAST. Devido a restrições de habitat, certas doenças ameaçam felinos selvagens e a invasão de habitat por animais domésticos pode alterar o padrão de propagação de patógenos. Destacamos a importância do diagnóstico molecular e da análise filogenética do FPV para elucidar como ele atinge os felídeos silvestres.
#7 - Molecular detection and phylogenetic analysis of Trypanosoma spp. in Neotropical primates from Rio de Janeiro State, Brazil
Abstract in English:
Trypanosoma spp. infection is a problem in many tropical countries, infecting several animal species, including humans. The aim of the present study was to identify the Trypanosoma species in Neotropical primates from Rio de Janeiro state and compare the results with other reports both phylogenetically and geographically. Molecular detection was based on the 18 SSU gene. The sequences obtained in the PCR were sequenced and compared with others previously deposited in GenBank. These sequences were used to perform phylogenetic analysis and make a distribution map of primate species infected by Trypanosoma species in Brazil. Among 34 monkeys, five capuchin monkeys (Sapajus spp.) and one marmoset (Callithrix spp.) showed Trypanosoma spp. sequences in the same clade of Trypanosoma minasense and three capuchin monkeys’ sequences were in the same clade of Trypanosoma cruzi. The Atlantic Forest and the Brazilian Amazon are the regions with the highest frequency of studies about Trypanosoma spp. and variety of Neotropical primate hosts. These are areas that deserve attention regarding the conservation of biodiversity, but it also makes evident the lack of studies with Neotropical primates in other regions of the country, as well as multidisciplinary studies to better understand the host pathogen relationships.
Abstract in Portuguese:
A infecção por Trypanosoma spp. é um problema em muitos países tropicais, infectando várias espécies animais, incluindo humanos. O objetivo do presente estudo foi identificar as espécies de Trypanosoma em primatas neotropicais no estado Rio de Janeiro e comparar os resultados com outros relatos, tanto filogeneticamente quando geograficamente. A detecção molecular foi baseada no gene SSU 18. As sequências obtidas na PCR foram sequenciadas e comparadas com outras previamente depositadas no GenBank. Essas sequências foram utilizadas para análises filogenéticas e confeccionar um mapa de distribuição de espécies de primatas infectadas por espécies de Trypanosoma no Brasil. Entre 34 macacos, cinco macacos-prego (Sapajus spp.) e um sagui (Callithrix spp.) apresentaram sequências de Trypanosoma spp. no mesmo clado de Trypanosoma minasense e três sequências de macacos-prego estavam no mesmo clado de Trypanosoma cruzi. A Mata Atlântica e a Amazônia brasileira são as regiões com maior frequência de estudos sobre Trypanosoma spp. e variedade de primatas neotropicais hospedeiros. São áreas que merecem atenção no que se refere à conservação da biodiversidade, mas também evidencia a carência de estudos com PNH em outras regiões do país e de estudos multidisciplinares para melhor compreender as relações do patógeno hospedeiro.
#8 - Diagnosis and phylogenetic analysis of bovine viral diarrhea virus in cattle (Bos taurus) and buffaloes (Bubalus bubalis) from the Amazon region and Southeast Brazil
Abstract in English:
Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a highly infectious pathogen that affects bovines worldwide leading to great economic impact. Although Brazil has the largest commercial cattle population throughout the world and an increasing buffalo breeding industry, the country has no control or eradication program for BVDV. In this perspective, the aim of this study was to evaluate the occurrence of BVDV in cattle and buffaloes from two Brazilian states. Four different ELISA tests were performed and confirmed by virus neutralization testing (VNT). The presence of BVDV antibodies in the serum or plasma from 77 cattle from six herds (ELISA-1 and ELISA-4) and from 89 buffaloes from three herds (ELISA-1 through ELISA-4) was detected. Extraction of viral RNA was performed from the serum or plasma samples for the detection of BVDV by RT-PCR analysis. Amplified nucleotide sequences were used to construct a phylogenetic tree. In cattle, ELISA-1 detected 49.4% of seropositive animals, while ELISA-4 detected 37.7%. In buffaloes, ELISA-1 failed to detect any seropositive animals, while ELISA-2 and ELISA-3 detected 20.2% of seropositive animals, and ELISA-4 detected 21.3%. Eight of the nine herds tested had seropositive animals. The rate of PCR positive animals was 6.5% in cattle and 9% in buffaloes. Subtype 1d was found in cattle, and subtypes 1d and 1f were found in buffaloes. This is the first-time subtype 1f has been reported in Brazil. The absence of a control and eradication program seems to be favoring the spread of BVDV in the Brazilian herds. In addition, the improvement of diagnostic strategies for BVDV in buffaloes are required.
Abstract in Portuguese:
Diarreia viral bovina (BVDV) é um patógeno altamente infeccioso que afeta bovinos em todo o mundo elevando o impacto econômico. Apesar de o Brasil possuir a maior população bovina comercial em todo o mundo e uma indústria de criação bubalina em ascendência, o país não tem programa de controle e erradicação para BVDV. Nessa perspectiva, o objetivo deste estudo é avaliar a ocorrência do BVDV em bovinos e bubalinos de dois estados brasileiros. Quatro testes de ELISA foram realizados e confirmados por teste de vírus neutralização (VNT). A presença de anticorpos contra BVDV no soro ou plasma de 77 bovinos de seis rebanhos (ELISA-1 e ELISA-4) e de 89 búfalos de três rebanhos (ELISA-1 ao ELISA-4) foi detectada. Extração de RNA viral foi realizada em amostras de soro ou plasma para detecção de BVDV por análise de RT-PCR. Sequências de nucleotídeos amplificadas foram utilizadas para construção de uma árvore filogenética. Em bovinos, o ELISA-1 detectou 49.4% dos animais soropositivos, enquanto ELISA-4 detectou 37.7%. Em búfalos, o ELISA-1 falhou em detectar animais soropositivos, enquanto o ELISA-2 e o ELISA-3 detectaram 20.2% dos animais soropositivos e o ELISA-4 detectou 21.3%. Oito de nove rebanhos continham animais soropositivos. A frequência de animais PCR positivos foi de 6.5% em bovinos e 9% em búfalos. Os subtipos 1d foi encontrado em bovinos e os subtipos 1d e 1f foram encontrados em búfalos. Este é o primeiro relato da presença do subtipo 1f no Brasil. A ausência de um programa de controle e erradicação parece favorecer a disseminação de BVDV nos rebanhos brasileiros. Além disso, a melhora de estratégias de diagnóstico para BVDV em búfalos é necessária.
#9 - Molecular characterization of goose parvovirus in geese of Turkey
Abstract in English:
Goose parvovirus (GPV), also called Derzsy’s disease, is a viral pathogen that causes high morbidity and mortality in goslings and ducklings. In this study, we perform the molecular characterization of the GPV in Turkey. The definition of similarity to the world of GPV isolates in Turkey and construction of a phylogenetic tree was aimed. For this purpose, the presence of GPV in the liver, spleen, and intestine tissues of nine goslings with symptoms such as dysphagia, bilateral ocular swelling, eye discharge, diarrhea, and fatigue were investigated by real-time PCR method and all samples were detected as positive. According to the data obtained by molecular characterization, phylogenetic analysis of GPV has been presented in Turkey. As a result of this study, it was determined that the GPVs available in Turkey are virulent strains.
Abstract in Portuguese:
O parvovírus do ganso (GPV), também chamado de doença de Derzsy, é um patógeno viral que causa alta morbidade e mortalidade em gansos e patinhos. Neste estudo, objetivou-se a determinação da caracterização molecular do GPV na Turquia, a definição da similaridade com o mundo dos isolados de GPV na Turquia e a construção de uma árvore filogenética. Para tanto, a presença de GPV no fígado, baço e tecidos do intestino de nove gansos com sintomas como disfagia, edema ocular bilateral, secreção ocular, diarreia e fadiga foram investigados pelo método de PCR em tempo real e todas as amostras foram detectadas tão positivo. À luz dos dados obtidos por caracterização molecular, a análise filogenética do GPV foi apresentada na Turquia. Como resultado deste estudo, foi determinado que os GPVs disponíveis na Turquia são cepas virulentas.
#10 - Epigenetic characterization of the H19/IGF2 locus in calf clones placenta
Abstract in English:
Somatic Cell Nuclear Transfer (SCNT-Cloning) is a promising technique in many areas and is based on genetically identical individuals. However, its efficiency is low. Studies suggest that the leading cause is inadequate epigenetic reprogramming. This study aimed to characterize the methylation pattern of the exon 10 regions of the IGF2 gene and the Imprinting Control Region (ICR) of the H19 gene in the placenta of cloned calves. For this study, female and male cloned calves presenting different phenotypes were used. Genomic DNA from these animals’ placenta was isolated, then treated with sodium bisulfite and amplified to the ICR/H19 and IGF2 loci. PCR products were cloned into competent bacteria and finally sequenced. A significant difference was found between controls and clones with healthy phenotypes for the ICR/H19 region. In this region, controls showed a hemimethylated pattern, as predicted in the literature due to this region has an imprinted control, while clones were showed less methylated. For the IGF2, no significant differences were found between controls and clones. These results suggest that different genomic regions in the genome may be independently reprogrammed and that failures in reprogramming the DNA methylation patterns of imprinted genes may be one of the causes of the low efficiency of SCNT.
Abstract in Portuguese:
A Transferência Nuclear de Células Somáticas (TNCS-Clonagem) é uma técnica promissora em várias áreas, e se baseia na produção de indivíduos geneticamente idênticos. No entanto, sua eficiência é baixa. Estudos sugerem que a principal causa seja uma reprogramação epigenética inadequada. O objetivo desse trabalho é caracterizar o padrão de metilação da região éxon 10 do gene IGF2 e da Região Controladora de Imprinting (ICR) do gene H19 na placenta de bezerros clonados. Para a execução do trabalho foram selecionados clones bovinos fêmeas e machos, apresentando diferentes fenótipos. O DNA da placenta desses animais foi extraído, e em seguida foi tratado com bissulfito de sódio e amplificado para os loci ICR/H19 e IGF2. Os produtos da PCR foram clonados em bactérias competentes e, por fim, sequenciados. Foi encontrada uma diferença significativa entre os controles e os clones com fenótipos saudáveis para a região da ICR/H19. Nesta região, os controles tiveram um padrão hemimetilado, como previsto pela literatura, devido essa região ser imprinted. Enquanto os clones encontravam-se menos metilados. Para a região do éxon 10 do IGF2, não foi encontrada diferença significativa entre controles e clones. Estes resultados sugerem que as diferentes regiões do genoma podem se reprogramar independente umas das outras e que falhas na reprogramação do padrão de metilação do DNA de genes imprinted podem ser uma das causas da baixa eficiência da TNCS.
