PESQUISA VETERINÁRIA BRASILEIRA

Abstract in English:

Sporotrichosis is a zoonotic cutaneous mycosis caused by saprophytic fungi of the Sporothrix, affecting cats, horses, dogs, and humans. This study aimed to evaluate sporotrichosis in cats clinically and to phenotypically characterize and molecularly characterize Sporothrix species on São Luís Island, Maranhão, Brazil. From October 2022 to July 2023, clinical assessments and cytological examinations were performed on suspected feline sporotrichosis cases at the Francisco Edilberto Uchôa Lopes Veterinary Hospital, State University of Maranhão. Lesion exudates were collected via exfoliation or imprinting for fungal culture and species identification. Fungal cultures underwent species-specific polymerase chain reaction (PCR), genetic sequencing, and phylogenetic analysis. A total of 46 cats (33 males and 13 females) were assessed. Disseminated cutaneous sporotrichosis was observed in 70% of cases, with lesions predominantly on the face, ears, thoracic regions, and limbs. Initially, white fungal cultures gradually turned blackish with a coriaceous texture characteristic of Sporothrix spp. PCR amplification of the calmodulin (CAL) gene using Sporothrix brasiliensis-specific primers confirmed all 46 samples as S. brasiliensis. Phylogenetic analysis revealed genetic identity rates ranging from 90% to 100% with S. brasiliensis sequences. This seems to be the first molecular confirmation of S. brasiliensis causing feline sporotrichosis on São Luís Island.

• Cats epidemiology outbreak phylogeny sporotrichosis Sporothrix spp. zoonosis

Abstract in Portuguese:

A esporotricose é uma micose cutânea zoonótica causada por fungos saprófitas pertencentes ao gênero Sporothrix que acomete gatos, cavalos, cães e humanos. Este estudo teve como objetivo avaliar clinicamente a esporotricose em gatos e caracterizar fenotípica e molecularmente as espécies de Sporothrix sp. na ilha de São Luís, estado do Maranhão, Brasil. De outubro de 2022 a julho de 2023, avaliações clínicas e exames citológicos foram realizados em casos suspeitos de esporotricose felina no Hospital Veterinário Francisco Edilberto Uchôa Lopes, Universidade Estadual do Maranhão. Exsudados de lesões foram coletados por esfoliação ou imprint para cultura fúngica e identificação de espécies. As culturas fúngicas foram submetidas à reação em cadeia em polimerase (RCP) espécie-específica, sequenciamento genético e analise filogenética. Um total de 46 gatos (33 machos e 13 fêmeas) foram avaliados. Esporotricose cutânea disseminada foi observada em 70% dos casos, com lesões predominantemente na face, orelhas, regiões torácicas e membros. Inicialmente, culturas fúngicas brancas gradualmente tornaram-se enegrecidas com uma textura coriácea característica de Sporothrix spp. A amplificação por PCR do gene calmodulina (CAL) usando primers específicos de Sporothrix brasiliensis confirmou todas as 46 amostras como S. brasiliensis. A análise filogenética revelou taxas de identidade genética variando de 90% a 100% com sequências de S. brasiliensis. Esta parece ser a primeira confirmação molecular de S. brasiliensis causando esporotricose felina na Ilha de São Luís.

• Gatos epidemiologia surto filogenia esporotricose Sporothrix spp. zoonose

Abstract in English:

Cattle trypanosomiasis imposes significant economic burdens on the global livestock industry. The causative agents of this disease belong to the protozoan Trypanosoma genus. This study aims to perform detection (parasitological and molecular) and genetic characterization to analyze Trypanosoma spp. in cattle from 15 municipalities in the state of Rio de Janeiro, focusing on the 18S rDNA and Cathepsin-L (CatL) gene of Trypanosoma vivax and Trypanosoma theileri. A total of 389 blood samples from 15 dairy cattle farms in the state of Rio de Janeiro were collected, and DNA was extracted for subsequent PCR amplification of Trypanosoma spp. 18S rDNA and CatL genes. The resulting amplicons underwent sequencing and alignment for phylogenetic analysis, with comparisons made to GenBank isolates. Concerning parasitological analysis, blood smears presented 4.4% of positive cattle (n=17/389) for T. vivax and did not show any trypomastigote forms of T. theileri. The absolute frequency of Trypanosoma spp. through molecular detection targeting 18S rDNA was 11.6% (45/389). However, when performing species-specific PCRs, the T. vivax frequency, determined through CatL gene PCR, was 12.8%, and the T. theileri frequency was 3.6%. Phylogenetic analysis based on 18S rDNA revealed low diversity among T. vivax sequences, suggesting potential host segregation. This study emphasizes the high frequency of positive samples by PCR when compared to direct parasitological exams. Additionally, T. vivax phylogeny targeting 18S rDNA hints at sequence clustering related to host species. Importantly, this investigation unveils, for the first time in Rio de Janeiro’s cattle, the circulation of T. theileri lineage ThI, encompassing genotypes IIB and IF. This discovery expands our understanding of this parasite’s geographical distribution and genetic diversity.

• Cattle trypanosomiasis Trypanosoma spp. genetic diversity phylogenetic analysis protozoan pathogens

Abstract in Portuguese:

A tripanossomíase bovina impõe significativos ônus econômicos à indústria pecuária global. Os agentes causadores dessa doença pertencem a protozoários do gênero Trypanosoma. Objetivou-se, com este estudo, realizar detecção (parasitológica e molecular) e caracterização genética de Trypanosoma spp. em bovinos de 15 municipalidades do estado do Rio de Janeiro, com foco na sequência 18S rDNA e no gene Cathepsin-L (CatL) de Trypanosoma vivax e Trypanosoma theileri. Um total de 389 amostras de sangue de 15 fazendas leiteiras no estado do Rio de Janeiro foram coletadas, e o DNA foi extraído para subsequente amplificação por PCR dos genes 18S rDNA e CatL de Trypanosoma spp. Os amplicons resultantes foram submetidos a sequenciamento e alinhamento para análise filogenética, com comparações realizadas com isolados do GenBank. No que se refere à análise parasitológica, os esfregaços de sangue apresentaram 4,4% de bovinos positivos (n=17/389) para T. vivax e não mostraram nenhuma forma tripomastigota de T. theileri. A frequência absoluta de Trypanosoma spp. através da detecção molecular visando 18S rDNA foi de 11,6% (45/389). No entanto, ao realizar PCRs específicos de espécies, a frequência de T. vivax, determinada por PCR do gene CatL foi de 12,8%, e a frequência de T. theileri foi de 3,6%. A análise filogenética com base no 18S rDNA revelou baixa diversidade entre as sequências de T. vivax, sugerindo uma possível segregação de hospedeiros. Este estudo enfatiza a alta frequência de amostra positiva pela PCR quando comparada com a parasitológica direta. Além disso, a filogenia de T. vivax direcionada ao 18S rDNA sugere agrupamento de sequências relacionado à espécie hospedeira. Importante destacar que esta investigação revela, pela primeira vez no gado do Rio de Janeiro, a circulação da linhagem ThI de T. theileri, abrangendo os genótipos IIB e IF. Esta descoberta amplia nosso entendimento sobre a distribuição geográfica e diversidade genética desse parasito.

• Tripanossomíase bovinos Trypanosoma spp. diversidade genética análise filogenética protozoários patogênicos

Abstract in English:

This study performed a molecular detection and characterization of Giardia duodenalis infecting pigs, goats and sheep in rural and peri-urban communities in the state of Piauí, northeastern Brazil, and proposed phylogenetic relationships among the characterized parasites. We assessed 52 fecal samples from pigs, 13 from goats, and 10 from sheep. A fragment of the β-giardin locus was PCR-amplified and sequenced. Overall, PCR-based G. duodenalis positivity was 11/52 (21.2%) in pigs, 2/13 (15.4%) in goats, and 2/10 (20%) in sheep. Seven out of 15 successfully amplified samples could be sequenced: three from pigs, two from goats, and two from sheep. Parasites from different hosts were found to belong to sub-assemblage AII. The phylogenetic analyses of the original G. duodenalis AII β-giardin sequences obtained from distinct host species and sequences of G. duodenalis recovered from humans available in GenBank suggest that the parasites are genetically related, supporting a local scenario of cross-host transmission.

• Giardia duodenalis pigs goat sheep β-giardin DNA sequencing Brazil

Abstract in Portuguese:

Este estudo teve como objetivo detectar e caracterizar geneticamente amostras de Giardia duodenalis recuperadas de suínos, caprinos e ovinos em comunidades rurais do estado do Piauí, no nordeste do Brasil, propondo relações filogenéticas entre os parasitas caracterizados. Foram estudadas 52 amostras fecais de suínos, 13 de caprinos e 10 de ovinos. Uma região (560 pb) do lócus codificante da β-giardina foi amplificada por PCR e submetida a sequenciamento nucleotídico. A positividade para G. duodenalis pela PCR foi 11/52 (21,2%) em suínos, 2/13 (15,4%) em caprinos e 2/10 (20%) em ovinos. De 15 amostras amplificadas, sete puderam ser sequenciadas: três obtidas de suínos, dois de caprinos e dois de ovinos. Todas foram caracterizadas como pertencentes à subassemblage AII. Análises filogenéticas de amostras de G. duodenalis AII identificadas em diferentes hospedeiros, incluindo sequências de parasitas recuperadas de humanos e obtidas no GenBank, sugerem que os isolados têm alto grau de homologia. Os resultados apontam para um cenário de transmissão cruzada entre diferentes espécies de hospedeiros.

• Giardia duodenalis suínos caprinos ovinos β-giardina sequenciamento de DNA Brasil

Abstract in English:

The decline in the jaguar population confirms how much the species is vulnerable to extinction in Brazil. It also indicates the degradation of its natural habitat’s environmental integrity and quality. Studies claim that large felids are susceptible to feline panleukopenia virus (FPV) and are presumptively diagnosed clinically in Brazil. A free-living jaguar (Panthera onca) cub was found unconscious and rescued due to a possible hit-and-run in the savannah of Mato Grosso. During recovery, it exhibited clinical and hematological signs consistent with FPV infection. The PCR was positive for FPV, with 99.61% identity between the FPV sequences available in the GenBank database through the BLAST tool. Due to habitat restrictions, certain diseases threaten wild cats and habitat encroachment by domestic animals can alter the pattern of spread of pathogens. We highlight the importance of the molecular diagnosis and phylogenetic analysis of FPV to elucidate how it has reached wild felids.

• Panleukopenia jaguar molecular diagnosis phylogenetic analysis

Abstract in Portuguese:

O declínio da população de onça-pintada confirma o quanto a espécie está vulnerável à extinção no Brasil, indicando também a degradação da integridade ambiental e da qualidade de seu habitat natural. Estudos afirmam que felinos de grande porte são suscetíveis ao vírus da panleucopenia felina (FPV) e são diagnosticados clinicamente de forma presuntiva no Brasil. Um filhote de onça-pintada (Panthera onca) de vida livre foi encontrado inconsciente e resgatado devido a um possível atropelamento no cerrado do Mato Grosso. Durante a recuperação, apresentou sinais clínicos e hematológicos compatíveis com infecção por FPV. A PCR foi positiva para FPV, com 99,61% de identidade entre as sequências de FPV disponíveis no banco de dados GenBank por meio da ferramenta BLAST. Devido a restrições de habitat, certas doenças ameaçam felinos selvagens e a invasão de habitat por animais domésticos pode alterar o padrão de propagação de patógenos. Destacamos a importância do diagnóstico molecular e da análise filogenética do FPV para elucidar como ele atinge os felídeos silvestres.

• Panleucopenia onça-pintada diagnóstico molecular análise filogenética

Abstract in English:

Trypanosoma spp. infection is a problem in many tropical countries, infecting several animal species, including humans. The aim of the present study was to identify the Trypanosoma species in Neotropical primates from Rio de Janeiro state and compare the results with other reports both phylogenetically and geographically. Molecular detection was based on the 18 SSU gene. The sequences obtained in the PCR were sequenced and compared with others previously deposited in GenBank. These sequences were used to perform phylogenetic analysis and make a distribution map of primate species infected by Trypanosoma species in Brazil. Among 34 monkeys, five capuchin monkeys (Sapajus spp.) and one marmoset (Callithrix spp.) showed Trypanosoma spp. sequences in the same clade of Trypanosoma minasense and three capuchin monkeys’ sequences were in the same clade of Trypanosoma cruzi. The Atlantic Forest and the Brazilian Amazon are the regions with the highest frequency of studies about Trypanosoma spp. and variety of Neotropical primate hosts. These are areas that deserve attention regarding the conservation of biodiversity, but it also makes evident the lack of studies with Neotropical primates in other regions of the country, as well as multidisciplinary studies to better understand the host pathogen relationships.

• Molecular detection phylogenetic Neotropical primates Trypanosoma cruzi Trypanosoma minasense Sapajus Callithrix Brazil

Abstract in Portuguese:

A infecção por Trypanosoma spp. é um problema em muitos países tropicais, infectando várias espécies animais, incluindo humanos. O objetivo do presente estudo foi identificar as espécies de Trypanosoma em primatas neotropicais no estado Rio de Janeiro e comparar os resultados com outros relatos, tanto filogeneticamente quando geograficamente. A detecção molecular foi baseada no gene SSU 18. As sequências obtidas na PCR foram sequenciadas e comparadas com outras previamente depositadas no GenBank. Essas sequências foram utilizadas para análises filogenéticas e confeccionar um mapa de distribuição de espécies de primatas infectadas por espécies de Trypanosoma no Brasil. Entre 34 macacos, cinco macacos-prego (Sapajus spp.) e um sagui (Callithrix spp.) apresentaram sequências de Trypanosoma spp. no mesmo clado de Trypanosoma minasense e três sequências de macacos-prego estavam no mesmo clado de Trypanosoma cruzi. A Mata Atlântica e a Amazônia brasileira são as regiões com maior frequência de estudos sobre Trypanosoma spp. e variedade de primatas neotropicais hospedeiros. São áreas que merecem atenção no que se refere à conservação da biodiversidade, mas também evidencia a carência de estudos com PNH em outras regiões do país e de estudos multidisciplinares para melhor compreender as relações do patógeno hospedeiro.

• Detecção molecular filogenética primatas neotropicais Trypanosoma cruzi Trypanosoma minasense Sapajus Callithrix Brasil

Abstract in English:

Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a highly infectious pathogen that affects bovines worldwide leading to great economic impact. Although Brazil has the largest commercial cattle population throughout the world and an increasing buffalo breeding industry, the country has no control or eradication program for BVDV. In this perspective, the aim of this study was to evaluate the occurrence of BVDV in cattle and buffaloes from two Brazilian states. Four different ELISA tests were performed and confirmed by virus neutralization testing (VNT). The presence of BVDV antibodies in the serum or plasma from 77 cattle from six herds (ELISA-1 and ELISA-4) and from 89 buffaloes from three herds (ELISA-1 through ELISA-4) was detected. Extraction of viral RNA was performed from the serum or plasma samples for the detection of BVDV by RT-PCR analysis. Amplified nucleotide sequences were used to construct a phylogenetic tree. In cattle, ELISA-1 detected 49.4% of seropositive animals, while ELISA-4 detected 37.7%. In buffaloes, ELISA-1 failed to detect any seropositive animals, while ELISA-2 and ELISA-3 detected 20.2% of seropositive animals, and ELISA-4 detected 21.3%. Eight of the nine herds tested had seropositive animals. The rate of PCR positive animals was 6.5% in cattle and 9% in buffaloes. Subtype 1d was found in cattle, and subtypes 1d and 1f were found in buffaloes. This is the first-time subtype 1f has been reported in Brazil. The absence of a control and eradication program seems to be favoring the spread of BVDV in the Brazilian herds. In addition, the improvement of diagnostic strategies for BVDV in buffaloes are required.

• BVDV ELISA buffalo bovine epidemiology phylogenetic Bos taurus Bubalus bubalis Brazil

Abstract in Portuguese:

Diarreia viral bovina (BVDV) é um patógeno altamente infeccioso que afeta bovinos em todo o mundo elevando o impacto econômico. Apesar de o Brasil possuir a maior população bovina comercial em todo o mundo e uma indústria de criação bubalina em ascendência, o país não tem programa de controle e erradicação para BVDV. Nessa perspectiva, o objetivo deste estudo é avaliar a ocorrência do BVDV em bovinos e bubalinos de dois estados brasileiros. Quatro testes de ELISA foram realizados e confirmados por teste de vírus neutralização (VNT). A presença de anticorpos contra BVDV no soro ou plasma de 77 bovinos de seis rebanhos (ELISA-1 e ELISA-4) e de 89 búfalos de três rebanhos (ELISA-1 ao ELISA-4) foi detectada. Extração de RNA viral foi realizada em amostras de soro ou plasma para detecção de BVDV por análise de RT-PCR. Sequências de nucleotídeos amplificadas foram utilizadas para construção de uma árvore filogenética. Em bovinos, o ELISA-1 detectou 49.4% dos animais soropositivos, enquanto ELISA-4 detectou 37.7%. Em búfalos, o ELISA-1 falhou em detectar animais soropositivos, enquanto o ELISA-2 e o ELISA-3 detectaram 20.2% dos animais soropositivos e o ELISA-4 detectou 21.3%. Oito de nove rebanhos continham animais soropositivos. A frequência de animais PCR positivos foi de 6.5% em bovinos e 9% em búfalos. Os subtipos 1d foi encontrado em bovinos e os subtipos 1d e 1f foram encontrados em búfalos. Este é o primeiro relato da presença do subtipo 1f no Brasil. A ausência de um programa de controle e erradicação parece favorecer a disseminação de BVDV nos rebanhos brasileiros. Além disso, a melhora de estratégias de diagnóstico para BVDV em búfalos é necessária.

• BVDV ELISA búfalo bovino epidemiologia filogenética Bos taurus Bubalus bubalis Brasil

Abstract in English:

Goose parvovirus (GPV), also called Derzsy’s disease, is a viral pathogen that causes high morbidity and mortality in goslings and ducklings. In this study, we perform the molecular characterization of the GPV in Turkey. The definition of similarity to the world of GPV isolates in Turkey and construction of a phylogenetic tree was aimed. For this purpose, the presence of GPV in the liver, spleen, and intestine tissues of nine goslings with symptoms such as dysphagia, bilateral ocular swelling, eye discharge, diarrhea, and fatigue were investigated by real-time PCR method and all samples were detected as positive. According to the data obtained by molecular characterization, phylogenetic analysis of GPV has been presented in Turkey. As a result of this study, it was determined that the GPVs available in Turkey are virulent strains.

• Goose parvovirus real-time pcr phylogenetic analysis Turkey geese

Abstract in Portuguese:

O parvovírus do ganso (GPV), também chamado de doença de Derzsy, é um patógeno viral que causa alta morbidade e mortalidade em gansos e patinhos. Neste estudo, objetivou-se a determinação da caracterização molecular do GPV na Turquia, a definição da similaridade com o mundo dos isolados de GPV na Turquia e a construção de uma árvore filogenética. Para tanto, a presença de GPV no fígado, baço e tecidos do intestino de nove gansos com sintomas como disfagia, edema ocular bilateral, secreção ocular, diarreia e fadiga foram investigados pelo método de PCR em tempo real e todas as amostras foram detectadas tão positivo. À luz dos dados obtidos por caracterização molecular, a análise filogenética do GPV foi apresentada na Turquia. Como resultado deste estudo, foi determinado que os GPVs disponíveis na Turquia são cepas virulentas.

• Parvovírus de ganso PCR em tempo real análise filogenética Turquia gansos

Abstract in English:

Avipoxvirus is the etiological agent of the avian pox, a well-known disease of captive and wild birds, and it has been associated with tumor-like lesions in some avian species. A white-faced whistling duck (Dendrocygna viduata) raised in captivity was referred to a Veterinary Teaching Hospital in Northeast due to cutaneous nodules present in both wings. A few days after the clinical examination, the animal died naturally. Once submitted to necropsy, histopathological evaluation of the lesions revealed clusters of proliferating epithelial cells expanding toward the dermis. Some of these cells had round, well-defined, intracytoplasmic eosinophilic material suggestive of poxvirus inclusion (Bollinger bodies). PCR performed on the DNA extracted from tissue samples amplified a fragment of the 4b core protein gene (fpv 167), which was purified and sequenced. This fragment of Avipoxvirus DNA present in these tumor-like lesions showed high genetic homology (100.0%) with other poxviruses detected in different avian species in several countries, but none of them were related to tumor-like lesions or squamous cell carcinoma. This is the first report of Avipoxvirus detected in tumor-like lesions of a white-faced whistling duck with phylogenetic analysis of the virus.

• Avipoxvirus tumor-like lesions white-faced whistling duck Dendrocygna viduata skin diseases viral diseases phylogenetic analysis Anatidae

Abstract in Portuguese:

Avipoxvirus é o agente etiológico da varíola (bouba) aviária, uma doença bem descrita em aves de cativeiro e selvagens, tendo sido associada a lesões semelhantes a tumores em algumas dessas espécies. Uma marreca piadeira (Dendrocygna viduata), criada em cativeiro, foi atendida em um Hospital Veterinário na região nordeste devido à presença de nódulos cutâneos em ambas as asas. Alguns dias após o exame clínico, o animal veio a óbito naturalmente. A ave foi submetida à necropsia e coletados fragmentos das lesões para análise histopatológica, que revelou proliferação de células epiteliais expandindo para a derme. Algumas dessas células possuíam material eosinofílico intracitoplasmático e bem definido, sugestivo de inclusão de poxvírus (corpúsculos de Bollinger). A PCR realizada a partir do DNA extraído de amostras das lesões amplificou um fragmento do gene da proteína do núcleo 4b (fpv 167), que foi purificado e sequenciado. Esse fragmento de DNA de Avipoxvirus presente nas lesões relevou alta homologia genética (100,0%) com outros poxvírus detectados em diferentes espécies de aves em vários países, mas nenhum deles estava relacionado a lesões tumorais ou carcinoma espinocelular. Este é o primeiro relato de Avipoxvirus detectado em lesões semelhantes a tumores em uma marreca piadeira com caracterização molecular do vírus.

• Avipoxvirus lesões tumorais marreca-irerê Dendrocygna viduata dermatopatias doenças virais análise filogenética Anatidae

Abstract in English:

ABSTRACT.- Vaz R.V., Gouveia G.V., Andrade N.M.J., Costa M.M. & Lima-Filho J.V. 2017. Phylogenetic characterization of serum plus antibiotic-resistant extraintestinal Escherichia coli obtained from the liver of poultry carcasses in Pernambuco. Pesquisa Veterinária Brasileira 37(10):1069-1073. Departamento de Biologia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Rua Dom Manoel de Medeiros s/n, Dois Irmãos, Recife, PE 52171-900, Brazil. E-mail: jose.mlimafo@ufrpe.br In this study, avian extraintestinal Escherichia coli obtained from the liver of poultry carcasses approved for human consumption in the State of Pernambuco-Brazil were tested for antibiotic plus serum-resistance. Liver samples (n=110) were obtained from one slaughterhouse and 88 bacterial isolates were identified as Escherichia coli. The antibiotic-resistance profiles of antibiotics used in human and/or veterinary practice were accessed by the disk-diffusion method. Phenotypes with high resistance to streptomycin (84.0%), tetracycline (44.7%), amikacin (29.8%), gentamicin (21.3%) and ciprofloxacin (21.3%) were identified. Resistance to antibiotics such as ceftazidime, amoxicillin-clavulanic acid and imipenem was also recorded. Twenty isolates with distinct antibiotic-resistance and susceptibility profiles were selected for serum resistance assays, phylogenetic characterization and detection of the iss gene. We have shown that multidrug resistant isolates were often simultaneously resistant to broiler and human sera. Phylogenetic characterization of serum- plus antibiotic-resistant isolates have shown three belonging to group D, eleven to group B1, one to group B2, and five to group A. We concluded that commensal E. coli strains isolated from the liver of healthy poultry carcasses can harbor and potentially share multidrug- plus virulence genes found in pathogenic pathotypes. This suspicion was not related to specific phylogenetic groups or presence of the iss gene.

• Antibiotic-resistancy Escherichia coli colibacillosis resistência antibiótica frango olibacilose

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Vaz R.V., Gouveia G.V., Andrade N.M.J., Costa M.M. & Lima-Filho J.V. 2017. Phylogenetic characterization of serum plus antibiotic-resistant extraintestinal Escherichia coli obtained from the liver of poultry carcasses in Pernambuco. [Caracterização filogenética de Escherichia coli extraintestinal soro- e antibiótico-resistentes isoladas do fígado de carcaças de frango em Pernambuco.] Pesquisa Veterinária Brasileira 37(10):1069-1073. Departamento de Biologia, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Rua Dom Manoel de Medeiros s/n, Dois Irmãos, Recife, PE 52171-900, Brazil. E-mail: jose.mlimafo@ufrpe.br Neste estudo, isolados de Escherichia coli extraintestinal aviária obtidos a partir do fígado de carcaças de aves aprovadas para consumo humano no Estado de Pernambuco-Brasil foram testados para resistência a antibióticos e soro. As amostras de fígado (n = 110) foram obtidas de um abatedouro, sendo 88 isolados bacterianos identificados como Escherichia coli. Os perfis de resistência a antibióticos de uso humano e/ou veterinário foram determinados pelo método de disco-difusão. Foram identificados fenótipos com alta resistência à estreptomicina (84,0%), tetraciclina (44,7%), amicacina (29,8%), gentamicina (21,3%) e ciprofloxacina (21,3%). A resistência a antibióticos utilizados na medicina humana e/ou veterinária, tais como a ceftazidima, amoxicilina-ácido clavulânico, estreptomicina e imipenem também foi registrada. Vinte amostras com perfis distintos de resistência/sensibilidade a antibióticos foram selecionadas para os ensaios de resistência ao soro, caracterização filogenética e detecção do gene iss. Foi demonstrado que isolados resistentes a múltiplas drogas foram também simultaneamente resistentes ao soro de frangos e ao soro humano. A caracterização filogenética desses isolados mostraram três pertencentes ao grupo D, onze ao grupo B1, um ao grupo B2 e cinco ao grupo A. Conclui-se que E. coli comensais isoladas do fígado de carcaças de aves saudáveis podem abrigar e potencialmente compartilhar genes de resistência a drogas e de virulência encontrados em patotipos patogênicos. Essa suspeita não foi relacionada com grupos filogenéticos específicos ou com a presença do gene iss.

Abstract in English:

ABSTRACT.- Kunert-Filho H.C., Cibulski S.P., Finkler F., Grassotti T.T., Jaenisch F.R.F., Brito K.C.T., Carvalho D., Lovato M. & Brito B.G. 2016. First phylogenetic analysis of Avipoxvirus (APV) in Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira 36(5):357-362. Laboratório de Saúde das Aves e Inovação Tecnológica, Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor, FEPAGRO Saúde Animal, Estrada do Conde 6000, Eldorado do Sul, RS 92990-000, Brazil. E-mail: hiran_veterinario@hotmail.com This study represents the first phylogenetic analysis of avian poxvirus recovered from turkeys in Brazil. The clinical disorders related to fowlpox herein described occurred in a turkey housing system. The birds displaying characteristic pox lesions which were observed on the neck, eyelids and beak of the turkeys. Four affected turkeys were randomly chosen, euthanized and necropsied. Tissues samples were submitted for histopathological analysis and total DNA was further extracted, amplified by conventional PCR, sequenced and phylogenetically analyzed. Avian poxviruses specific PCR was performed based on P4b core protein gene sequence. The histological analysis revealed dermal inflammatory process, granulation tissue, hyperplasia of epithelial cells and inclusion bodies. The P4b gene was detected in all samples. Sequencing revealed a 100% nucleotide and amino acid sequence identity among the samples, and the sequences were deposited in GenBank®. The four Avian poxviruses fragments sequenced in this study clustered along the A1 clade of avipoxviruses, and were classified as Avipoxvirus (APV). Additional studies, such as virus isolation, PCR and sequencing includinga large number of specimens from the Brazilian turkey production must be conducted due to the hazardous risk that poxvirus infections may cause to the Brazilian poultry production scenario, given that Brazil’s turkey production attracts attention due to its economic importance worldwide. Our findings point to the need to identify the prevalence of APV in Brazilian turkey production, to perform risk assessment studies and continued surveillance of APV infections in both wild and commercial avian species.

• Poxviridae Avipoxvirus phylogenetic analysis análise filogenética

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Kunert-Filho H.C., Cibulski S.P., Finkler F., Grassotti T.T., Jaenisch F.R.F., Brito K.C.T., Carvalho D., Lovato M. & Brito B.G. 2016. First phylogenetic analysis of Avipoxvirus (APV) in Brazil. [Primeira análise filogenética de Avipoxvirus (APV) no Brasil.] Pesquisa Veterinária Brasileira 36(5):357-362. Laboratório de Saúde das Aves e Inovação Tecnológica, Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor, FEPAGRO Saúde Animal, Estrada do Conde 6000, Eldorado do Sul, RS 92990-000, Brazil. E-mail: hiran_veterinario@hotmail.com Este trabalho representa a primeira análise filogenética de Poxvirus aviário detectado em perus no Brasil. Os distúrbios clínicos relacionados com bouba aviária aqui descritos ocorreram em um sistema de alojamento de perus. As aves apresentaram lesões características de varíola observadas no pescoço, pálpebras e bico das aves. Quatro perus com sinais característicos foram escolhidos aleatoriamente, sacrificados e submetidos à autópsia. Amostras de tecido foram submetidas à análise histopatológica e o DNA total foi extraído, amplificado por PCR convencional e os amplicons foram sequenciados e analisados ​​filogeneticamente. A PCR específica para Poxvírus aviário foi realizada com base na seqüência do gene da proteína do núcleo P4b. A análise histológica revelou um processo inflamatório dérmico, tecido de granulação, hiperplasia de células epiteliais e corpúsculos de inclusão. O gene P4b foi detectado em todas as amostras. O sequenciamento revelou uma identidade entre nucleotídeos e aminoácido de 100% entre as amostras e as sequências foram depositadas no GenBank®. Os quatro fragmentos de poxvírus aviário sequenciado neste estudo foram agrupados no clado A1 de avipoxvirus e foram classificados como Avipoxvirus (APV). Estudos adicionais, como isolamento viral, PCR e sequenciamento, incluindo um grande número de perus da produção brasileira devem ser conduzidos devido ao grave risco que a infecção por poxvírus pode causar ao cenário de produção avícola brasileira, tendo em vista que a produção brasileira de perus atrai atenção devido a sua importância mundial. Nossos resultados apontam para a necessidade de identificar a prevalência da APV na produção de peru no Brasil, para realizar estudos de avaliação de risco e continuada monitoração de infecções por APV nas espécies de aves comerciais e silvestres.