Resultado da pesquisa (42)
Termo utilizado na pesquisa Bactérias
#1 - Detection of ESBL-producing strains at the veterinary necropsy environment
Abstract in English:
The emergence and spread of resistance to antimicrobials is one of the three main threats to public health in the 21st century. It must be analyzed using an integrated One Health approach, as it is a health risk shared by people, animals, and the environment. Among these, the necropsy space represents a point of cohesion, being an extremely relevant place for research and understanding the circulation of the bacterial microbiota and its resistance genes. The present study evaluated the occurrence of superbugs in samples from animals necropsied at the Federal Rural University of Rio de Janeiro, considering the priority criteria established by the World Health Organization (WHO). Of the 198 samples collected from 45 animals, 20 pet animals, 20 production animals and three wild animals, 325 strains were isolated, of which 51.38% (167/325) were Enterobacterales, 31.69% (103/325) Staphylococcus spp., 12.62% (41/325) Enterococcus spp., 2.46% (8/325) Streptococcus spp. and 1.85% (6/325) non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB). In 29.13% (30/103) of Staphylococcus spp., the blaZ gene was detected, and in enterobacteria, the presence of blaSHV was detected in 10.18% (17/167), blaTEM in 6.59% (11/167) and blaCTX-M-1 in 4.19% (7/167). These results reveal the occurrence of species characterized as critical superbugs by the WHO in the necropsy environment and reinforce the need to monitor these strains in the veterinary environment not only for the adoption of appropriate control and treatment measures for animals but also for the implementation of protocols safe for the disposal of their carcasses.
Abstract in Portuguese:
O surgimento e a disseminação da resistência aos antimicrobianos é uma das três principais ameaças à saúde pública no século XXI, e deve ser analisado em uma abordagem integrada de Saúde Única, por se tratar de um risco à saúde compartilhado por pessoas, animais e meio ambiente. Dentre estes, o espaço de necropsia representa um ponto de coesão, sendo um local de extrema relevância para pesquisa e compreensão da circulação da microbiota bacteriana e seus genes de resistência. O presente estudo avaliou a ocorrência de superbactérias em amostras de animais necropsiados na Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, considerando os critérios de prioridade estabelecidos pela Organização Mundial de Saúde (OMS). Das 198 amostras coletadas de 45 animais, sendo 20 animais de companhia, 20 de produção e três selvagens, foram isoladas 325 cepas, das quais 51,38% (167/325) foram Enterobacterales, 31,69% (103/325) Staphylococcus spp., 12,62% (41/325) Enterococcus spp., 2,46% (8/325) Streptococcus spp. e 1,85% (6/325) bacilos Gram-negativos não fermentadores (BGNNF). Em 29,13% (30/103) dos Staphylococcus spp. houve detecção do gene blaZ e nas enterobactérias detectou a presença de blaSHV em 10,18% (17/167), blaTEM em 6,59% (11/167) e blaCTX-M-1 em 4,19% (7/167). Esses resultados revelam a ocorrência de espécies caracterizadas como superbactérias críticas pela OMS em ambiente de necropsia e reforçam a necessidade de monitoramento dessas cepas no ambiente veterinário não apenas para a adoção de medidas de controle e tratamento adequados dos animais, mas também para a implementação de protocolos seguros para o descarte de suas carcaças.
#2 - Mass spectrometry-based identification of 26 Pasteurella species and in vitro antimicrobial susceptibility pattern of isolates recovered from diseased domestic cats
Abstract in English:
Pasteurella species are well-known opportunistic bacteria that inhabit the microbiota of the oral cavity and upper respiratory tract of cats and have been related to a set of pet-associated diseases in addition to humans. Most studies involving feline pasteurellosis have been described as case reports and species identification based on classic phenotypic methods. In turn, a lack of comprehensive studies involving a great number of cats with pasteurellosis has been described, especially where diagnosis at the species level has been performed by molecular-based methods. In this scenario, we investigated the molecular identification of Pasteurella species isolated from 26 diseased domestic cats (i.e., cutaneous abscesses, pneumonia, conjunctivitis, open wounds, urinary tract infections, pleural effusion, pyometra, and infection secondary to neoplasia) based on proteomic diagnosis, using mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). The in vitro antimicrobial susceptibility patterns of isolates and selected epidemiological data (with emphasis on the outcome) were assessed as well. MALDI-TOF MS identified predominantly P. multocida (23/26=88.5%), followed by P. dagmatis (2/26=7.7%) and P. canis (1/26=3.8%). The isolates revealed 100% susceptibility to beta-lactams (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, cephalexin, ceftriaxone), tetracyclines (tetracycline, doxycycline) and fluoroquinolones (ciprofloxacin, levofloxacin, marbofloxacin) groups of antimicrobials. Conversely, the highest resistance of the isolates was observed for amikacin (10/26=38%). Data on outcomes were available for 61% (16/26) of cats, of which 50% (8/16) died or were subjected to euthanasia due to severe complications (e.g., sepsis, pneumonia, and pleural effusion) secondary to disseminated/systemic infections, although no significant association was observed between Pasteurella species and the clinical-epidemiological findings studied. Our results contribute to the molecular identification of Pasteurella species and vigilance of multidrug-resistant bacteria that infect cats. Also, it highlights the need for the early diagnosis and therapy of feline pasteurellosis due to high mortality rates.
Abstract in Portuguese:
As espécies de Pasteurella são bactérias oportunistas que habitam a microbiota da cavidade oral e do trato respiratório superior de gatos, relacionadas a vários sinais clínicos em animais de companhia e humanos. A maioria dos estudos envolvendo pasteurelose felina têm sido descritos como relatos de casos, e a identificação de espécies baseada em métodos clássicos de classificação fenotípica. No entanto, número restrito de estudos têm focado grande número de gatos com pasteurelose, nos quais métodos moleculares tenham sido utilizados para o diagnóstico dos patógenos em nível da espécie. Neste cenário, foi investigada a identificação molecular de espécies de Pasteurella isoladas de 26 gatos domésticos com diferentes manifestações clínicas (e.g., abscessos cutâneos, pneumonia, conjuntivite, feridas, infecções do trato urinário, derrame pleural, piometra e infecção secundária à neoplasia), com base no diagnóstico por proteômica, utilizando a espectrometria de massas (Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). O perfil de sensibilidade microbiana in vitro dos isolados e dados epidemiológicos dos animais (com ênfase no desfecho dos casos) também foram avaliados. MALDI-TOF MS identificou predominantemente P. multocida (23/26=88,5%), seguido por P. dagmatis (2/26=7,7%) e P. canis (1/26=3,8%). Os isolados revelaram 100% de sensibilidade aos grupos de antimicrobianos beta-lactâmicos (amoxicilina/ácido clavulânico, ampicilina, cefalexina, ceftriaxona), tetraciclinas (tetraciclina, doxiciclina) e fluoroquinolonas (ciprofloxacino, levofloxacino, marbofloxacino). Por outro lado, a maior resistência dos isolados foi observada para a amicacina (10/26=38%). Os dados de desfecho estavam disponíveis para 61% (16/26) dos gatos, dos quais 50% (8/16) morreram ou foram submetidos à eutanásia devido a graves complicações secundárias a infecções disseminadas/sistêmicas, embora nenhuma associação estatística tenha sido observada entre as espécies de Pasteurella e os achados clínico-epidemiológicos estudados. Os resultados do presente estudo contribuem para a identificação molecular de espécies de Pasteurella e para a vigilância de bactérias multirresistentes que infectam gatos, indicando a necessidade de diagnóstico e tratamento precoces da pasteurelose felina devido às altas taxas de mortalidade.
#3 - Investigation of enterobacteria with zoonotic and multi-resistant potential in exotic parrots kept in a domestic environment
Abstract in English:
This investigation elucidated the presence of potentially zoonotic and antimicrobial-resistant bacteria in domestically reared psittacines. The present study was sanctioned by the Animal Ethics Committee of the State University of Ceará (CEUA-UECE) and bears registration number 03423745/2023. A total of 111 cloacal swab samples were procured from exotic psittacines encompassing six distinct species: the Australian budgerigar (Melopsittacus undulatus), cockatiels (Nymphicus hollandicus), lovebirds (Agapornis sp.), rose-ringed parakeets (Psittacula krameri), red-rumped parrots (Psephotus haematonotus), and rosellas (Platycercus eximius). The process encompassed the isolation and characterization of enterobacteria and ascertaining their resistance profiles. Among the collected specimens, 70.2% (78/111) yielded growth indicative of one or more enterobacterial agents. The collective isolates comprised 110 strains encompassing 13 distinct bacterial species. Foremost among these was Escherichia coli, accounting for a significant percentage of the total isolates at 30% (33/110), followed by Pantoea agglomerans at 27.2% (30/110). The study revealed that 35.4% (39/110) of the isolates exhibited resistance to tobramycin, with tetracycline and fosfomycin showing resistance rates of 34.5% (38/110) and 30.9% (34/110), respectively. Particularly noteworthy was that E. coli showed a heightened propensity for tetracycline resistance at 51.5% (17/33), while resistance rates to tobramycin and gentamicin were 36.6% (12/33) and 15.1% (5/33), respectively. A noteworthy subset of the enterobacterial cohort exhibited multidrug resistance patterns (28.9%, 32/110). Collectively, these outcomes underscore not only an elevated prevalence of enterobacterial strains but also the pervasive phenomenon of antimicrobial resistance across a diverse spectrum of antimicrobial agents.
Abstract in Portuguese:
Este estudo investigou a presença de bactérias potencialmente zoonóticas e resistentes a antimicrobianos em psitacídeos criados em ambiente doméstico. Esse projeto foi aprovado pela Comissão de Ética para o Uso de Animais da Universidade Estadual do Ceará (CEUA-UECE), registrado sob o número 03423745/2023. Foram coletadas 111 amostras de suabes cloacais de psitacídeos exóticos de seis espécies, incluindo, periquitos-australianos (Melopsittacus undulatus), calopsitas (Nymphicus hollandicus), agapornis (Agapornis sp.), periquitos-de-colar (Psittacula krameri), periquitos-dorso-vermelho (Psephotus haematonotus) e roselas (Platycercus eximius). Foi realizado o isolamento e a identificação de enterobactérias e determinado o perfil de resistência. Das amostras coletadas, 70,2% (78/111) apresentaram crescimento para uma ou mais enterobactérias. Foram isoladas 110 cepas pertencentes a 13 espécies bacterianas. Escherichia coli apresentou o maior índice de isolamento, com 30% (33/110). Em segundo lugar Pantoea agglomerans, com um percentual de isolamento de 27,2% (30/110). Observou-se que 35,4% (39/110) das enterobactérias apresentaram resistência à tobramicina, seguidas da tetraciclina com 34,5% (38/110) e da fosfomicina com 30,9% (34/110). E. coli apresentou maior taxa de resistência a tetraciclina com 51,5% (17/33), seguida de 36,6% (12/33) para tobramicina e 15,1% (5/33) para gentamicina. Das enterobactérias analisadas 28,9% (32/110), apresentaram multirresistência. Os resultados indicam uma alta prevalência de enterobactérias, a resistência antimicrobiana foi constatada em diversas classes de antimicrobianos.
#4 - Species identification and antimicrobial susceptibility profile of bacteria associated with cow mastitis in southern Brazil
Abstract in English:
Bovine mastitis is the most common disease in dairy cattle and responsible for economic losses in the milk industry. The present study aimed to identify the main species and to evaluate the antimicrobial susceptibility of bacterial isolates from cow herds with mastitis in dairy farms from southern Brazil. A total of 107 milk samples were collected from different cow herds in one important dairy producing region in southern Brazil, including farms located in ten cities from the Northeast region in the Rio Grande do Sul state. Bacterial strains were isolated and submitted to presumptive identification by classical bacteriological methods. Bacterial species were also identified by MALDI-TOF MS and antimicrobial susceptibility testing was performed with 12 antimicrobials commonly used in dairy farms. Fifty-one bacterial strains were isolated and the presumptive identification demonstrated the occurrence of Staphylococcus spp. (82.3%), Bacillus spp. (3.9%), Klebsiella spp. (3.9%), Streptococcus spp. (3.9%), Corynebacterium sp. (2%), Enterococcus sp. (2%) and Serratia sp. (2%). Forty-one isolates were successfully identified in the MALDI-TOF analysis, including 35 isolates from eleven different bacterial species. Importantly, there were eight different Staphylococcus species, with a high frequency of Staphylococcus chromogenes (48.6%) and Staphylococcus aureus (20%). Overall, bacterial isolates demonstrated resistance to penicillin (46.3%), tetracycline (39%), amoxicillin (36.6%), ampicillin (34.1%) and sulfamethoxazole/trimethoprim (31.7%). Enrofloxacin was the unique antimicrobial that all isolates were susceptible. In addition, there were six multidrug resistant isolates (five S. chromogenes and one S. aureus). This study highlights that bacterial pathogens with resistance to several antimicrobials were identified in cows from dairy farms in a very important milk producing region located in southern Brazil. Microbial identification of the bovine mastitis pathogens and determination of the antimicrobial profile is necessary for the rational use of the medicines.
Abstract in Portuguese:
A mastite bovina é a doença mais comum em gado leiteiro e responsável por perdas econômicas na indústria de laticínios. O presente estudo teve como objetivo identificar as principais espécies e avaliar a suscetibilidade antimicrobiana de isolados bacterianos de rebanhos bovinos com mastite em fazendas leiteiras no sul do Brasil. Um total de 107 amostras de leite foram coletadas em diferentes rebanhos bovinos em uma importante região produtora de leite do sul do Brasil, incluindo fazendas localizadas em 10 cidades da região Nordeste do estado do Rio Grande do Sul. As cepas bacterianas foram isoladas e submetidas à identificação presuntiva por métodos bacteriológicos clássicos. A identificação bacteriana foi confirmada por MALDI-TOF MS e o teste de sensibilidade antimicrobiana foi realizado com antimicrobianos comumente usados em fazendas leiteiras. Cinquenta e uma cepas bacterianas foram isoladas e a identificação presuntiva demonstrou a ocorrência de Staphylococcus spp. (82,3%), Bacillus spp. (3,9%), Klebsiella spp. (3,9%), Streptococcus spp. (3,9%), Corynebacterium sp. (2%), Enterococcus sp. (2%) e Serratia sp. (2%). Os 41 isolados foram identificados com sucesso na análise MALDI-TOF, incluindo 35 isolados de onze espécies bacterianas diferentes. É importante ressaltar que houve a ocorrência de oito espécies diferentes de Staphylococcus, com alta frequência de Staphylococcus chromogenes (48,6%) e Staphylococcus aureus (20%). No geral, os isolados bacterianos tiveram alta resistência à penicilina (46,3%), tetraciclina (39%), amoxicilina (36,6%), ampicilina (34,1%) e sulfametoxazol/trimetoprima (31,7%). A enrofloxacina foi o único antimicrobiano que todos os isolados foram suscetíveis. Além disso, havia seis isolados multirresistentes (cinco S. chromogenes e um S. aureus). Este estudo destaca que os patógenos bacterianos com resistência aos antimicrobianos estão presentes em fazendas leiteiras de subsistência em uma importante região produtora no sul do Brasil. É necessário o monitoramento constante dos patógenos da mastite bovina e a determinação de seu perfil antimicrobiano para o uso racional dos medicamentos.
#5 - Pathological, microbiological and immunohistochemical characterization of avian colibacillosis in broiler chickens of Mozambique
Abstract in English:
Avian colibacillosis is an acute and globally occurring infectious disease of domestic and wild birds caused by Escherichia coli, and it is associated with considerable economic losses mainly due to the morbidity and mortality associated. The present study aimed to describe the pathological, bacteriological and immunohistochemical aspects of avian colibacillosis in broiler chickens of Mozambique. Forty-nine broiler chicken presented anorexia, decreased weight gain, ataxia, diarrhea, dyspnea, and death in a clinical course of 3-5 days. The birds were raised in five farms (small, medium and large farms) with manual and automatic breeding system, with flocks ranging from 100 to 20,000 birds. At the necropsy, all birds had poor body condition, and the pericardium and the Glisson’s capsule of all avian exhibited different degrees of adherence often associated with severe fibrin deposition. The thoracic and abdominal air sacs were thickened and adhered to the costal wall. Mild, moderate or marked hepatomegaly associated with white pinpoint multifocal areas (100%, 49/49) and mild to moderate splenomegaly in 75.5% (37/49) with a mottled surface were observed. The lungs and kidney were enlarged and reddish. Histologically, a multiorgan fibrinoheterophilic polyserositis was observed in 75.5% of the cases (37/49), which were characterized by inflammatory infiltrates composed mainly of degenerative heterophils, macrophages and plasma cells, associated with fibrin deposits and intermixed by coccobacillary bacterial basophilic aggregates. These affected mainly the pericardium (28.6%, 14/49), the pleura (18.4%, 9/49), the Glisson’s capsule (10.2%, 5/49), the ventriculus (10.2, 5/33), and the proventriculus (8.2%, 4/49) serosa. Multifocal to coalescing areas of coagulative necrosis associated with similar inflammatory cells were observed mainly in the spleen (28.6%, 14/49), liver (24.5%, 12/49), and intestines (22.4%, 11/49). A similar infiltrate was also observed affecting the the lungs (16.3%, 8/49), the kidney (16.3%, 8/49) and the myocardium (14.3%, 7/49). Isolation and identification of E. coli was obtained in 12 cases through bacterial culture. Some organs (2 cases of each farms) were selected and submitted to immunohistochemistry anti-E. coli, and a positive stain was observed in all tested cases in liver (3/3), heart (4/4), spleen (1/1), lungs (4/4), intestines (4/4), bursa of Fabricius (1/1), ventriculus (1/1), and proventriculus (1/1) tissue sections. These results demonstrate that E. coli was the cause of mortality in these birds. Therefore, biosecurity and management measures should be employed to prevent and control the disease occurrence in Mozambique’s poultry farming.
Abstract in Portuguese:
A colibacilose aviária é uma doença aguda de ocorrência mundial que acomete aves domésticas e silvestres, causada por Escherichia coli e resulta em perdas econômicas consideráveis devido à elevada morbidade e mortalidade das aves. O presente estudo teve o objetivo de descrever os aspectos patológicos, bacteriológicos e imuno-histoquímicos de colibacilose aviária em frangos de corte de Moçambique. Um total de 49 frangos de corte apresentaram anorexia, baixo ganho de peso, ataxia, diarreia, dispneia e morte em um curso clínico de 3 a 5 dias. As aves eram provenientes de 5 granjas (pequenas, média e grandes), com sistema de criação manual e automático, com rebanhos que variavam de 100 a 20.000 aves. À necropsia, todas as aves exibiam condição corporal ruim a caquética, além de pericárdio e cápsula de Glisson de todas aves (100%; n=49) com diferentes graus de aderência e deposição de fibrina de forma difusa acentuada. Os sacos aéreos torácicos e abdominais estavam espessados e aderidos à parede costal. Foi observado ainda hepatomegalia discreta, moderada a severa frequentemente associada com áreas multifocais puntiformes brancacentas (100%; 49/49), e esplenomegalia discreta a moderada, associado a áreas multifocais moteadas (75,5%; 37/49). Os pulmões e rins estavam aumentados e com coloração avermelhada. Histologicamente, observou-se majoritariamente serosite fibrinoheterofílica em 75,5% dos casos (37/49), caracterizadas por infiltrado inflamatório composto por heterófilos degenerados, macrófagos, linfócitos e plasmócitos, com deposição de fibrina entremeada por uma miríade de estruturas bacterianas cocobacilares. Esta lesão foi observada principalmente em pericárdio (28,6%; 14/49), pleura (18,4%; 9/49), cápsula de Glisson (10,2%; 5/49), ventrículo (10,2; 5/33) e em proventrículo (8,2%; 4/49). Áreas multifocais a coalescentes de necrose de coagulação associada a infiltrado inflamatório semelhante ao descrito foi observado principalmente no baço (28,6%; 14/49), fígado (24.5%; 12/49), e intestinos (8,2%; 4/49). Um infiltrado inflamatório semelhante também foi visualizado em pulmões (16,3%; 8/49), rins (16,3%; 8/49) e miocárdio (14,3%; 7/49), Colônias puras de E. coli foram identificadas e isoladas em 12 casos. Alguns órgãos (2 de cada granja) foram submetidos ao exame imuno-histoquímico anti-E. coli e marcação positiva foi visualizada em todos casos testados, como em fígado (3/3), coração (4/4), baço (1/1), pulmão (4/4), intestinos (4/4), bursa de Fabricius (1/1), rim (1/1), ventrículo (1/1) e proventrículo (1/1). Estes resultados demonstram que E. coli foi a causa de morte destas aves. Sendo assim, a adoção de boas medidas de biosseguridade e de manejo são indispensáveis para a prevenção e controle da ocorrência da doença nas granjas de frango de corte de Moçambique.
#6 - Antimicrobial susceptibility profile of enterobacteria isolated from wild grey-breasted parakeets (Pyrrhura griseipectus)
Abstract in English:
The grey-breasted parakeet (Pyrrhura griseipectus) is an endangered psittacine species that have been affected by illegal trade and deforestation. Currently, this endemic species is only found in three areas in Ceará state, in Brazil. This study aimed to investigate the frequency and diversity of Enterobacteriaceae in wild adult grey-breasted parakeets and determine their susceptibility to antimicrobial agents. Cloacal swab samples were collected from 27 individuals and environmental swabs (drag swabs) from five nests used by these birds. Twenty-seven strains from nine species of Enterobacteriaceae were recovered from cloacal swabs, and the most prevalent bacteria strains were Hafnia alvei (22%) and Pantoea agglomerans (22%). From environmental nest samples, seven strains from three bacterial species were isolated, being the P. agglomerans the most frequent species (100%). Twenty-two of the 27 isolates (81.4%) exhibited antibiotic resistance, varying from one to eight of the 12 antimicrobials commonly used. Resistance to amoxicillin was the most prevalent (70.4%), followed by azithromycin (22.2%) and ceftriaxone (18.5%). None of the strains were resistant to gentamicin, tobramycin, ciprofloxacin or tetracycline. The H. alvei was the main species presenting multidrug resistance, including resistance against meropenem, which is an important finding. These results could provide interesting information on the health of these endangered wild grey-breasted parakeets. They could also indicate that the obtained isolates are part of a group of bacteria that are typical components of the enteric microbiota of birds, which present elevated rates of resistance to amoxicillin.
Abstract in Portuguese:
O periquito-de-cara-suja (Pyrrhura griseipectus) é uma espécie de psitacídeo considerado pela IUCN como ameaçado de extinção, resultado do comércio ilegal e do desmatamento. Atualmente, essa espécie endêmica é encontrada apenas em três áreas no estado do Ceará, Brasil. O objetivo deste estudo foi investigar a frequência e a diversidade de Enterobacteriaceae em periquitos de peito cinza adultos selvagens e determinar sua suscetibilidade a agentes antimicrobianos. Amostras de suabes cloacais foram coletadas de 27 indivíduos e de suabes ambientais (suabes de arrasto) de cinco ninhos utilizados por essas aves. Vinte e sete cepas de nove espécies de Enterobacteriaceae foram isoladas a partir de suabes cloacais, sendo as cepas bacterianas mais prevalentes Hafnia alvei (22%) e Pantoea agglomerans (22%). Das amostras ambientais de ninhos foram isoladas sete linhagens de três espécies bacterianas, sendo P. agglomerans a espécie mais frequente (100%). Vinte e dois dos 27 isolados (81,4%) exibiram resistência a antibióticos, variando de um a oito dos 12 antimicrobianos comumente usados. A resistência a amoxicilina foi a mais prevalente (70,4%), seguida por azitromicina (22,2%) e ceftriaxona (18,5%). Nenhuma das cepas era resistente à gentamicina, tobramicina, ciprofloxacina ou tetraciclina. H. alvei foi a principal espécie que apresentou resistência a múltiplas drogas e que também esteve associada a um outro achado relevante desta pesquisa, que foi a detecção de um caso de resistência ao meropenem. Esses dados fornecem informações relevantes sobre a saúde desses periquitos selvagens ameaçados e permite concluir que os isolados obtidos fazem parte de um grupo de bactérias que normalmente compõe a microbiota entérica das aves, sendo a amoxicilina envolvida em elevadas taxas de resistência.
#7 - Zoonotic bacteria research and analysis of antimicrobial resistance levels in parrot isolates from pet shops in the city of Fortaleza, Brazil
Abstract in English:
The Psittaciformes are among the most popular pets due to their intelligence, ability, and ease of maintenance in small environments. However, the absence of adequate environmental stimuli generated by confinement can predispose these animals to characteristic stress conditions, leaving them susceptible to the triggering of various diseases, among which those of bacterial origin stand out. The objective of this study was to carry out a survey of enterobacteria and evaluate the antimicrobial sensitivity profile of bacteria isolated from parrots from a pet shop in the city of Fortaleza, Ceará. Ninety-six samples were collected from four pet shops (which were classified as A, B, C and D), eight samples of local swabs from budgerigar (Melopsittacus undulatus), were collected from each establishment eight from cockatiels (Nymphicus hollandicus) and eight from lovebirds (Agapornis sp.). Isolation of enterobacteria is under the methodology used by Lopes et al. (2015) with modifications. The method used to study bacterial resistance was the Kirby-Bauer method, following the standards stipulated by the Clinical and Laboratory Standards Institute. Sixty-eight enterobacteria strains from ten different species, Proteus mirabilis, Citrobacter diversus, Pantoea agglomerans, Escherichia coli, Providencia stuartii, Hafnia alvei, Proteus vulgaris, Serratia liquefaciens, Enterobacter sakasakii and Citrobacter amalonaticus, were isolated. P. agglomerans was the bacterium with the highest frequency of isolates from pet shop parrots, making up 23.5% of the isolates; the second-most isolated strain was P. mirabilis with 17.7%. In this study, 79% of the isolated strains were resistant to at least one class of antimicrobials tested. Tetracycline proved to be the most resistant antimicrobial (44%), followed by polymyxin B (38%) and nalidixic acid (25%). Among the 68 strains, 19% did not show resistance to any of the classes of antimicrobials tested. The condition of multidrug resistance - resistance to ≥3 classes of antimicrobials - was observed in 18% of the isolated strains.
Abstract in Portuguese:
Os psittaciformes estão entre os animais de estimação mais populares devido sua inteligência, habilidade, além da facilidade de manutenção da espécie em pequenos ambientes. Contudo, a ausência de estímulos ambientais adequados gerados pelo confinamento, podem predispor esses animais a quadros característicos de estresse, deixando-os susceptíveis ao desencadeamento de várias doenças dentre elas se destacam as de origem bacteriana. O objetivo desse trabalho foi realizar uma pesquisa de enterobactérias e avaliar o perfil de sensibilidade antimicrobiana de bactérias isoladas de psitacídeos de pet shop da cidade de Fortaleza, Ceará. Foram coletadas 96 amostras de quatro pet shops (os quais foram classificados em A, B, C e D), sendo coletados de cada estabelecimento oito amostras de suabes clocais oriundos de periquitos australianos (Melopsittacus undulatus), oito de calopsitas (Nymphicus hollandicus) e oito de agapornis (Agapornis sp.). O isolamento de enterobactérias está de acordo com a metodologia utilizada por Lopes et al. (2015) com modificações. O método utilizado para o estudo de resistência bacteriana foi o de Kirby-Bauer, seguindo os padrões estipulados pela Clinical and Laboratory Standards Institute. Foi isolado um total de 68 cepas de enterobactérias, de dez espécies diferentes, Proteus mirabilis, Citrobacter diversus, Pantoea agglomerans, Escherichia coli, Providencia stuartii, Hafnia alvei, Proteus vulgaris, Serratia liquefaciens, Enterobacter sakasakii e Citrobacter amalonaticus. Pantoea agglomerans foi a bactéria com maior percentagem de frequência dos isolados de psitacídeos de pet shop, perfazendo um total de 23,5% dos isolados, a segunda cepa mais isolada foi Proteus mirabilis com 17,7%. Neste estudo 79% das cepas isoladas foram resistentes a pelo menos uma classe de antimicrobianos testados, tetraciclina demonstrou ser o antimicrobiano com maior resistência (44%), seguido da polimixina B (38%) e do ácido nalidíxico (25%). Dentre as 68 cepas isoladas, 19% não apresentaram resistência a qualquer uma das classes de antimicrobianos testadas. A condição de multirresistência, ou seja, resistência a ≥3 classes de antimicrobianos foi observado em 18% das cepas isoladas.
#8 - Clinical and microbiological characteristics of dogs in sepsis in an academic veterinary hospital in the north of Paraná
Abstract in English:
Sepsis is a life-threatening organ dysfunction caused by a patient’s unregulated response to an infectious process. In veterinary medicine, the exact incidence of sepsis is unknown. Early recognition of sepsis in critically ill patients is essential for rapid and effective therapeutic intervention. The present study aimed to apply the criteria of an adapted sepsis assessment protocol based on the Second International Consensus Definition for Sepsis and Septic Shock or Sepsis-2 of human medicine, in canine patients with suspected systemic inflammatory response syndrome (SIRS) and/or organ dysfunction, and to identify infectious agents as well as their antimicrobial resistance profile in the focus of infection, in the bloodstream and colonizing the rectal mucosa. Patients were evaluated for survival and severity of sepsis. Of the 37/42 dogs that met the sepsis criteria, six presented septic shock, 26 (70.2%) had at least two signs of SIRS, and sepsis with organ dysfunction was diagnosed in 27 (73%) dogs. The primary dysfunctions observed were decreased level of consciousness in 21/37 (56.8%), hyperlactatemia in 19/37 (51.4%), and hypoalbuminemia in 18/37 (48.6%). Two or more SIRS signs associated with hypotension and hypoalbuminemia were related to more than half of the deaths. The most frequent infectious focus was skin and soft tissue in 20/37 (54%), followed by organs and cavities in 8/37 (21.6%). The survival rate was 56.7%. Blood culture confirmed bacteremia in nine patients (24.3%), with a predominance of Gram-positive microorganisms (Staphylococcus intermedius, Streptococcus spp.) in 66.6% of dogs and one yeast (Candida glabrata). The most frequent bacteria in the focus of infection were gram-negative bacteria (46.2%), mainly Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas aeruginosa, in 19.5%, 14.6%, and 12.1%, respectively. We observed colonization by gram-negative bacteria such as E. coli-ESBL (31.5%), K. pneumoniae-ESBL (15.7%), and P. aeruginosa (15.7%), and the presence of ESBL bacteria was more associated with death when compared with other microorganisms. Vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) were isolated from rectal mucosa in four dogs. Gram-negative microorganisms were the most frequent in both infections and colonization, and most of them were resistant to fluoroquinolones, sulfonamides, tetracyclines, and cephalosporins. Based on this information, it can be concluded that mortality due to sepsis in dogs was high. Due to the presence of multi-resistant bacteria, the use of antimicrobials should be judicious, suggesting the implementation of the same precautions used in human hospitals to prevent the spread of multi-resistant microorganisms.
Abstract in Portuguese:
A sepse é uma disfunção orgânica ameaçadora à vida, causada por uma resposta desregulada do hospedeiro à infecção e na medicina veterinária sua incidência exata é desconhecida. O reconhecimento precoce da sepse nos pacientes críticos é essencial para que a intervenção terapêutica seja rápida e eficaz. Assim, os objetivos do presente estudo foram aplicar os critérios de um protocolo de avaliação da sepse adaptado com base no Segundo Consenso Internacional para Sepse e Choque Séptico, ou Sepse-2, da medicina humana, em pacientes caninos com suspeita de infecção e/ou Síndrome da Resposta Inflamatória Sistêmica e/ou disfunção orgânica e identificar os agentes infecciosos bem como seu perfil de resistência a antimicrobianos no foco de infecção, na corrente sanguínea e colonizando a mucosa retal. Os pacientes foram avaliados quanto à sobrevivência e severidade da sepse. Dos 37/42 cães que se enquadraram nos critérios de sepse, seis estavam em choque séptico, 26 (70,2%) apresentaram pelo menos dois sinais de SIRS, e a sepse com disfunção orgânica foi diagnosticada em 27 (73%) cães. As principais disfunções verificadas foram diminuição do nível de consciência em 21/37 (56,8%), hiperlactatemia em 19/37 (51,4%) e hipoalbuminemia em 18/37 (48,6%). A presença de dois ou mais sinais de SIRS associados com hipotensão e hipoalbuminemia estiveram relacionadas com mais da metade dos óbitos. O foco infeccioso mais frequente foi pele e partes moles em 20/37 (54%) seguido por órgãos e cavidades em 8/37 (21,6%). A taxa de sobrevivência foi de 56,7%. Na hemocultura confirmou-se bacteremia em nove pacientes (24,3%), com predominância de microrganismos gram-positivos (Staphylococcus intermedius, Streptococcus spp.) em 66,6% dos cães e uma levedura (Candida glabrata). As bactérias mais frequentes no foco de infecção foram as gram-negativas (46,2%) principalmente Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa, em 19,5%, 14,6% e 12,1% respectivamente. Foi constatada colonização por bactérias gram-negativas como E. coli-ESBL (31,5%), K. pneumoniae-ESBL (15,7%) e P. aeruginosa (15,7%), sendo que a colonização de cães por bactérias ESBL foi associada ao óbito quando comparada com outros microrganismos. Foram também isolados da mucosa retal Enterococcus resistentes à vancomicina (VRE) em quatro cães. Os microrganismos gram-negativos foram os mais frequentes, tanto nas infecções quanto nas colonizações e a maioria apresentava resistência à fluorquinolonas, sulfonamidas, tetraciclinas e cefalosporinas. Com base nestas informações, conclui-se que a mortalidade em decorrência da sepse em cães foi alta, e devido à presença de bactérias multirresistentes, o uso de antimicrobianos deve ser criterioso, sugerindo-se ainda a implantação das mesmas precauções utilizadas em hospitais humanos para evitar disseminação de microrganismos multirresistentes.
#9 - Antimicrobial resistance evaluation of bacteria isolated from infections in small animals in the Umuarama region, Paraná
Abstract in English:
Bacterial resistance is shown to be an inevitable side effect due to the excessive use of antibiotics, becoming a significant concern worldwide. Knowledge of regional bacterial resistance profiles enables the development of site-specific infection control practices, making conscious and moderate use of commercially available antibiotics. The aim of this study was the retrospective evaluation of the antimicrobial resistance profile of bacteria isolated from companion animal infections in the region of Umuarama/PR, from 2013 to 2017. This research was performed by analyzing the database belonging to the “Laboratório de Microbiologia Animal” at the “Universidade Estadual de Maringá” (UEM). Staphylococcus spp. represented 45.53% of the bacteria isolated from clinical infections in small animals in the period and place evaluated, followed by enterobacteria (34.04%), non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB, 11.06%) and Streptococcus/Enterococcus (9.36%). A high number of antimicrobial resistance to antibiotics used in veterinary medicine was found. The lowest resistances associated with the best impact factor values were found for aminoglycosides, especially amikacin, chloramphenicol, and fluoroquinolones (norfloxacin and ciprofloxacin). Intermediate results were found for sulbactam-associated ampicillin, ceftriaxone, amoxicillin-clavulanic acid, and enrofloxacin. According to the number of resistant antimicrobial drugs, 64.26% (151/235) of the isolates were classified as multidrug-resistant, being 15.32% extensively resistant. Considering the resistance to antimicrobial classes, 68.94% (162/235) of the isolates were classified as multiresistant, being 19.15% extensively resistant. No bacterial strains were characterized as pan-resistant, but ten bacteria were resistant to all classes tested, with isolated susceptibility to certain drugs. Through the evaluation of resistance profiles found in the period and place studied and relevant literature, it is clear that there is a growing increase in the number of multiresistant bacteria among domestic animals which characterizes a serious risk to public health. The therapeutic arsenal is becoming increasingly diminished, and there is more difficulty in empirical drug selection, making antimicrobial susceptibility testing essential for more specific selection in antimicrobial therapy. Educational measures on the conscious use of antibiotics, infection control, and prevention of local specific zoonoses need to be instituted for the knowledge of health professionals and general access of the population.
Abstract in Portuguese:
A resistência bacteriana, mostra-se como um efeito colateral inevitável pelo excessivo uso de antibióticos, tornando-se alvo de grande preocupação mundial. O conhecimento dos perfis de resistência bacteriana regionais possibilita o desenvolvimento de práticas de controle de infecções específicas para cada localidade, fazendo uso consciente e moderado dos antibióticos disponíveis no mercado. O objetivo deste estudo foi a avaliação retrospectiva do perfil de resistência antimicrobiana de bactérias isoladas de infecções de animais de companhia na região de Umuarama/PR, no período de 2013 a 2017. Esta pesquisa foi realizada por meio da análise do banco de dados pertencente ao Laboratório de Microbiologia Animal da Universidade Estadual de Maringá (UEM). Os Staphylococcus spp. representaram 45,53% das bactérias isoladas de infecções clínicas em pequenos animais no período e local avaliado, seguido por enterobactérias (34,04%), bacilos Gram-negativos não fermentados (BGNNF, 11,06%) e Streptococcus/Enterococcus (9,36%). Um número elevado de resistência antimicrobiana frente aos antibióticos utilizados na medicina veterinária foi encontrado. As menores resistências associadas aos melhores valores do fator de impacto foram encontrados para aminoglicosídeos, em especial amicacina, cloranfenicol, fluoroquinolonas (norfloxacina e ciprofloxacina). Já resultados intermediários foram encontrados para ampicilina associada a sulbactam, ceftriaxona, amoxacilina com ácido clavulônico e enrofloxacina. Conforme o número de drogas antimicrobianas resistentes, foram classificados como multirresistentes 64,26% (151/235) dos isolados, sendo 15.32% extensivamente resistentes. Já considerando a resistência a classes de antimicrobianos, 68,94% (162/235) dos isolados foram classificados como multirresistentes, sendo 19.15% extensivamente resistentes. Nenhum isolado bacteriano foi caracterizado como pan-resistente, porém 10 bactérias foram resistentes a todas as classes testadas, com susceptibilidade isolada a determinadas drogas. Por meio da avaliação dos perfis de resistência encontrados no período e local estudados e de literatura pertinente, percebe-se que há um aumento crescente no número de bactérias multirresistentes entre os animais domésticos o que caracteriza um grave risco à saúde pública. O arsenal terapêutico está se tornando cada vez mais diminuto e há mais dificuldade na seleção empírica de drogas, tornando essencial a realização de testes de susceptibilidade antimicrobiana para uma seleção mais específica na terapêutica antimicrobiana. Medidas educativas sobre o uso consciente dos antibióticos, controle de infecções e prevenção de zoonoses específicas para as localidades precisam ser instituídas para conhecimento dos profissionais do setor da saúde e acesso geral da população.
#10 - mcr-1-carrying Enterobacteriaceae isolated from companion animals in Brazil
Abstract in English:
Plasmid-mediated polymyxin resistance was first described in 2015, in China, in Escherichia coli carrying the mcr-1 (Mobile Colistin Resistance-1) gene. Since then, it has become a major public health challenge worldwide, representing a major threat to human and animal health. In addition, there are still few reports on the prevalence of mcr-1 in Enterobacteriaceae isolated from humans, animals and food. Therefore, the purpose of the study was to investigate the occurrence of the mcr-1 gene in bacterial isolates with phenotypic resistance to polymyxin B obtained from clinical specimens of companion animals. Phenotypic resistance to polymyxin B were determined by broth microdilution and the susceptibility profile to other antimicrobials (amikacin, amoxicillin/clavulanate, ampicillin, ampicillin/sulbactam, aztreonam, cefazolin, cefepime, cefotaxime, cefoxitin, ceftazidime, ceftriaxone, chloramphenicol, ciprofloxacin, doxycycline, ertapenem, gentamicin, imipenem, marbofloxacin, meropenem, phosphomycin, piperacillin/tazobactam, tetracycline, ticarcillin/clavulanate, tobramycin and trimethoprim/sulfamethoxazole) by disc-diffusion agar method. The extraction of bacterial DNA was performed via heat shock followed by spectrophotometric evaluation. To verify the presence of mcr-1, the Polymerase Chain Reaction was employed using specific primers, followed by agarose gel electrophoresis. The positive isolates had the corresponding amplicons sequenced. In this study, there were identified the first isolates of Escherichia coli, Klebsiella spp. and Enterobacter spp. carrying the mcr-1 gene derived from specimens of companion animals in Brazil. Our results suggest the dissemination of resistance to polymyxins in the community and the environment, highlighting the need for surveillance and optimized treatment guidelines.
Abstract in Portuguese:
A resistência à polimixina mediada por plasmídeo teve sua primeira descrição em 2015, na China, em Escherichia coli portadora do gene mcr-1 (Mobile Colistin Resistance-1) e a partir de então tornou-se um grande desafio para a saúde pública em todo o mundo, constituindo uma grande ameaça à saúde humana e animal. Além disso, ainda existem poucos relatos sobre a prevalência de mcr-1 em Enterobacteriaceae isoladas de humanos, animais e alimentos. Sendo assim, o objetivo do estudo foi investigar a ocorrência do gene mcr-1 em isolados bacterianos com resistência fenotípica à polimixina B, oriundos de materiais clínicos de animais de companhia. A resistência fenotípica à polimixina B foi determinada por microdiluição em caldo e o perfil de sensibilidade aos demais antimicrobianos (amicacina, amoxicilina/clavulanato, ampicilina, ampicilina/sulbactam, aztreonam, cefazolina, cefepime, cefotaxima, cefoxitina, ceftazidima, ceftriaxona, cloranfenicol, ciprofloxacina, doxiciclina, ertapenem, gentamicina, imipinem, marbofloxacino, meropenem, fosfomicina, piperacilina/tazobactam, tetraciclina, ticarcilina/clavulanato, tobramicina sulfametoxazol/trimetoprim) foram determinados pelo método disco difusão. A extração do DNA bacteriano foi realizada via choque térmico, seguido de avaliação espectrofotométrica. Para a verificação da presença do mcr-1 foi utilizada a Reação em Cadeia da Polimerase com emprego de iniciadores específicos, seguida de eletroforese em gel de agarose. Os isolados positivos tiveram os correspondentes amplicons sequenciados. Nesse estudo foram identificados os primeiros isolados de Escherichia coli, Klebsiella spp. e Enterobacter spp. portadores do gene mcr-1 derivados de espécimes de animais de companhia no Brasil. Este estudo sugere a disseminação da resistência às polimixinas na comunidade e no meio ambiente, destacando a necessidade de vigilância e diretrizes otimizadas de tratamento.
