Resultado da pesquisa (2)
Termo utilizado na pesquisa espectrometria de massas
#1 - Mass spectrometry-based identification of 26 Pasteurella species and in vitro antimicrobial susceptibility pattern of isolates recovered from diseased domestic cats
Abstract in English:
Pasteurella species are well-known opportunistic bacteria that inhabit the microbiota of the oral cavity and upper respiratory tract of cats and have been related to a set of pet-associated diseases in addition to humans. Most studies involving feline pasteurellosis have been described as case reports and species identification based on classic phenotypic methods. In turn, a lack of comprehensive studies involving a great number of cats with pasteurellosis has been described, especially where diagnosis at the species level has been performed by molecular-based methods. In this scenario, we investigated the molecular identification of Pasteurella species isolated from 26 diseased domestic cats (i.e., cutaneous abscesses, pneumonia, conjunctivitis, open wounds, urinary tract infections, pleural effusion, pyometra, and infection secondary to neoplasia) based on proteomic diagnosis, using mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). The in vitro antimicrobial susceptibility patterns of isolates and selected epidemiological data (with emphasis on the outcome) were assessed as well. MALDI-TOF MS identified predominantly P. multocida (23/26=88.5%), followed by P. dagmatis (2/26=7.7%) and P. canis (1/26=3.8%). The isolates revealed 100% susceptibility to beta-lactams (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, cephalexin, ceftriaxone), tetracyclines (tetracycline, doxycycline) and fluoroquinolones (ciprofloxacin, levofloxacin, marbofloxacin) groups of antimicrobials. Conversely, the highest resistance of the isolates was observed for amikacin (10/26=38%). Data on outcomes were available for 61% (16/26) of cats, of which 50% (8/16) died or were subjected to euthanasia due to severe complications (e.g., sepsis, pneumonia, and pleural effusion) secondary to disseminated/systemic infections, although no significant association was observed between Pasteurella species and the clinical-epidemiological findings studied. Our results contribute to the molecular identification of Pasteurella species and vigilance of multidrug-resistant bacteria that infect cats. Also, it highlights the need for the early diagnosis and therapy of feline pasteurellosis due to high mortality rates.
Abstract in Portuguese:
As espécies de Pasteurella são bactérias oportunistas que habitam a microbiota da cavidade oral e do trato respiratório superior de gatos, relacionadas a vários sinais clínicos em animais de companhia e humanos. A maioria dos estudos envolvendo pasteurelose felina têm sido descritos como relatos de casos, e a identificação de espécies baseada em métodos clássicos de classificação fenotípica. No entanto, número restrito de estudos têm focado grande número de gatos com pasteurelose, nos quais métodos moleculares tenham sido utilizados para o diagnóstico dos patógenos em nível da espécie. Neste cenário, foi investigada a identificação molecular de espécies de Pasteurella isoladas de 26 gatos domésticos com diferentes manifestações clínicas (e.g., abscessos cutâneos, pneumonia, conjuntivite, feridas, infecções do trato urinário, derrame pleural, piometra e infecção secundária à neoplasia), com base no diagnóstico por proteômica, utilizando a espectrometria de massas (Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). O perfil de sensibilidade microbiana in vitro dos isolados e dados epidemiológicos dos animais (com ênfase no desfecho dos casos) também foram avaliados. MALDI-TOF MS identificou predominantemente P. multocida (23/26=88,5%), seguido por P. dagmatis (2/26=7,7%) e P. canis (1/26=3,8%). Os isolados revelaram 100% de sensibilidade aos grupos de antimicrobianos beta-lactâmicos (amoxicilina/ácido clavulânico, ampicilina, cefalexina, ceftriaxona), tetraciclinas (tetraciclina, doxiciclina) e fluoroquinolonas (ciprofloxacino, levofloxacino, marbofloxacino). Por outro lado, a maior resistência dos isolados foi observada para a amicacina (10/26=38%). Os dados de desfecho estavam disponíveis para 61% (16/26) dos gatos, dos quais 50% (8/16) morreram ou foram submetidos à eutanásia devido a graves complicações secundárias a infecções disseminadas/sistêmicas, embora nenhuma associação estatística tenha sido observada entre as espécies de Pasteurella e os achados clínico-epidemiológicos estudados. Os resultados do presente estudo contribuem para a identificação molecular de espécies de Pasteurella e para a vigilância de bactérias multirresistentes que infectam gatos, indicando a necessidade de diagnóstico e tratamento precoces da pasteurelose felina devido às altas taxas de mortalidade.
#2 - Rapid identification of bovine mastitis pathogens by MALDI-TOF Mass Spectrometry
Abstract in English:
Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has been shown to be an alternative method for identification of bacteria via their protein profile spectra, being able to identify bacteria at the genus, species and even at subspecies level. With the aim of large-scale identification of pathogens causing mastitis by this platform, a total of 305 isolates of bacteria identified from cows with subclinical mastitis were analyzed by conventional microbiological culture (MC) as well as by MALDI-TOF MS coupled with Biotyper data processing. Approximately 89% of the identifications performed by MALDI-TOF MS were consistent with results obtained by MC. From the remaining isolates (11%), 6.3% of isolates were classified as misidentified (discordance for both genus and species level), and 4.7% showed identification agreement at the genus level but not at the species level, being classified as unidentified at species level. The disagreement results were mostly associated with identification of Streptococcus and Enterococcus species probably due to the narrow phenotypic similarity between these two genera. These disagreement results suggest that biochemical assays might be prone to identification errors and, MALDI-TOF MS therefore may be an alternative to overcome incorrect species-specific identification. Standard microbiological methods for bovine mastitis diagnosis are time consuming, laborious and prone to errors for some bacteria genera. In our study, we showed that MALDI-TOF MS coupled with Biotyper may be an alternative method for large-scale identification of bacteria isolated from milk samples compared to classical microbiological routine protocols.
Abstract in Portuguese:
A espectrometria de massas (MALDI-TOF MS) tem mostrado ser um método alternativo para a identificação de bactérias, sendo capaz de identificar as bactérias causadoras de mastite em gênero, espécie ou até mesmo subespécie. Com o objetivo de identificar os patógenos causadores de mastite em grande-escala por esta plataforma, um total de 305 isolados bacterianos oriundos de vacas com mastite subclínica foram analisados pela cultura microbiológica convencional (CM) e pela MALDI-TOF MS acoplada ao software Biotyper. Aproximadamente 89% das identificações realizadas pela MALDI-TOF MS foram consistentes com os resultados obtidos pela CM. Do restante de isolados bacterianos (11%), 6,3% foram classificados como identificação errônea (discordância de gênero e espécie), e 4,7% apresentaram concordância de gênero, mas discordância da espécie. Os resultados que apresentaram divergência estavam mais associados com a identificação das espécies de Streptococcus spp. e Enterococcus spp. devido à similaridade fenotípica entre os dois gêneros. Estes resultados divergentes sugerem que os ensaios bioquímicos podem ser propensos a erros de identificação, por isso a MALDI-TOF MS pode ser considerada um método alternativo para superar os erros de identificação da CM. A cultura microbiológica padrão e os ensaios bioquímicos utilizados na identificação de agentes causadores de mastite são demorados, trabalhosos e propensos a erros quando utilizados na identificação em nível de espécie. No presente estudo, demonstramos que a MALDI-TOF MS acoplada ao software Biotyper pode ser considerada um método alternativo de identificação de bactérias causadoras de mastite em grande-escala quando comparado com a cultura microbiológica convencional.
