Resultado da pesquisa (2)
Termo utilizado na pesquisa multidrug-resistant bacteria
#1 - Mass spectrometry-based identification reveals the complexity of microorganisms involved in umbilical infections in lambs clinically scored
Abstract in English:
We investigated the microbiological etiology of umbilical infections in clinically scored lambs. A total of 128 lambs showing signs of umbilical infection and 41 showing no umbilical signs were sampled. All microorganisms were identified by mass spectrometry (MALDI-TOF MS), and the in vitro antimicrobial susceptibility/resistance patterns of bacteria were assessed. Among the diseased animals and those without umbilical signs, 214 and 116 species of microorganisms (bacteria and yeasts) were identified, respectively. Escherichia coli (11.21%) was the most prevalent microorganism and showed a significant association (p = 0.0039) with moderate (score 2) and severe (score 3) scores for umbilical infection. In lambs without clinical signs of umbilical infection, a predominance of Desemzia incerta was observed. Diseased lambs that exhibited clinical complications showed a high mortality rate (58%). Additionally, a significant association (p < 0.001) was observed between moderate and severe scores and poor prognosis. Bacterial multidrug resistance was observed in 20% (36/182) of isolates. To our knowledge, some bacteria were identified for the first time as primary agents of umbilical infections in lambs, and clinical scoring was applied for the first time in newborn lambs with omphalopathies. Our findings reveal a high complexity of microorganisms in umbilical infections in lambs, identified by mass spectrometry, with a predominance of E. coli in cases of moderate to severe severity scores, and an association between clinical complications and high mortality.
Abstract in Portuguese:
A etiologia microbiana das infecções umbilicais em cordeiros, com avaliação dos escores de gravidade clínica, foi investigada em 128 animais com sinais de infecção umbilical e 41 aparentemente sadios. Todos os microrganismos foram identificados por espectrometria de massas (MALDI-TOF MS), assim como foi investigado o perfil in vitro de sensibilidade/resistência aos antimicrobianos dos isolados bacterianos. Nos animais com e sem infecção umbilical foram identificadas 214 e 116 espécies de microrganismos (bactérias e leveduras), respectivamente. Escherichia coli (11,21%) foi o microrganismo mais prevalente e mostrou associação significante (p = 0,0039) com escores moderados (escore 2) e graves (escore 3) para infecção umbilical. Em cordeiros sem sinais clínicos de infecção umbilical observou-se o predomínio de Desemzia incerta. Cordeiros com infecção umbilical que apresentaram complicações clínicas apresentaram elevada mortalidade (58%). Foi observada ainda associação significante (p < 0,001) entre escores de gravidade clínica moderado e grave e prognóstico desfavorável. A multirresistência bacteriana foi observada em 20% (36/182) dos isolados. Na literatura consultada, certas bactérias foram identificadas pela primeira vez como agentes primários de infecções umbilicais em cordeiros, bem como escores de gravidade clínica foram adotados pioneiramente em cordeiros neonatos com onfalopatias. O presente estudo revelou alta complexidade de microrganismos nas infecções umbilicais em cordeiros indetificados por espectrometria de massas, com predomínio de E. coli nos casos moderados e graves e alta taxa de mortalidade nas infecções umbilicais com complicações clínicas.
#2 - Mass spectrometry-based identification of 26 Pasteurella species and in vitro antimicrobial susceptibility pattern of isolates recovered from diseased domestic cats
Abstract in English:
Pasteurella species are well-known opportunistic bacteria that inhabit the microbiota of the oral cavity and upper respiratory tract of cats and have been related to a set of pet-associated diseases in addition to humans. Most studies involving feline pasteurellosis have been described as case reports and species identification based on classic phenotypic methods. In turn, a lack of comprehensive studies involving a great number of cats with pasteurellosis has been described, especially where diagnosis at the species level has been performed by molecular-based methods. In this scenario, we investigated the molecular identification of Pasteurella species isolated from 26 diseased domestic cats (i.e., cutaneous abscesses, pneumonia, conjunctivitis, open wounds, urinary tract infections, pleural effusion, pyometra, and infection secondary to neoplasia) based on proteomic diagnosis, using mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). The in vitro antimicrobial susceptibility patterns of isolates and selected epidemiological data (with emphasis on the outcome) were assessed as well. MALDI-TOF MS identified predominantly P. multocida (23/26=88.5%), followed by P. dagmatis (2/26=7.7%) and P. canis (1/26=3.8%). The isolates revealed 100% susceptibility to beta-lactams (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, cephalexin, ceftriaxone), tetracyclines (tetracycline, doxycycline) and fluoroquinolones (ciprofloxacin, levofloxacin, marbofloxacin) groups of antimicrobials. Conversely, the highest resistance of the isolates was observed for amikacin (10/26=38%). Data on outcomes were available for 61% (16/26) of cats, of which 50% (8/16) died or were subjected to euthanasia due to severe complications (e.g., sepsis, pneumonia, and pleural effusion) secondary to disseminated/systemic infections, although no significant association was observed between Pasteurella species and the clinical-epidemiological findings studied. Our results contribute to the molecular identification of Pasteurella species and vigilance of multidrug-resistant bacteria that infect cats. Also, it highlights the need for the early diagnosis and therapy of feline pasteurellosis due to high mortality rates.
Abstract in Portuguese:
As espécies de Pasteurella são bactérias oportunistas que habitam a microbiota da cavidade oral e do trato respiratório superior de gatos, relacionadas a vários sinais clínicos em animais de companhia e humanos. A maioria dos estudos envolvendo pasteurelose felina têm sido descritos como relatos de casos, e a identificação de espécies baseada em métodos clássicos de classificação fenotípica. No entanto, número restrito de estudos têm focado grande número de gatos com pasteurelose, nos quais métodos moleculares tenham sido utilizados para o diagnóstico dos patógenos em nível da espécie. Neste cenário, foi investigada a identificação molecular de espécies de Pasteurella isoladas de 26 gatos domésticos com diferentes manifestações clínicas (e.g., abscessos cutâneos, pneumonia, conjuntivite, feridas, infecções do trato urinário, derrame pleural, piometra e infecção secundária à neoplasia), com base no diagnóstico por proteômica, utilizando a espectrometria de massas (Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). O perfil de sensibilidade microbiana in vitro dos isolados e dados epidemiológicos dos animais (com ênfase no desfecho dos casos) também foram avaliados. MALDI-TOF MS identificou predominantemente P. multocida (23/26=88,5%), seguido por P. dagmatis (2/26=7,7%) e P. canis (1/26=3,8%). Os isolados revelaram 100% de sensibilidade aos grupos de antimicrobianos beta-lactâmicos (amoxicilina/ácido clavulânico, ampicilina, cefalexina, ceftriaxona), tetraciclinas (tetraciclina, doxiciclina) e fluoroquinolonas (ciprofloxacino, levofloxacino, marbofloxacino). Por outro lado, a maior resistência dos isolados foi observada para a amicacina (10/26=38%). Os dados de desfecho estavam disponíveis para 61% (16/26) dos gatos, dos quais 50% (8/16) morreram ou foram submetidos à eutanásia devido a graves complicações secundárias a infecções disseminadas/sistêmicas, embora nenhuma associação estatística tenha sido observada entre as espécies de Pasteurella e os achados clínico-epidemiológicos estudados. Os resultados do presente estudo contribuem para a identificação molecular de espécies de Pasteurella e para a vigilância de bactérias multirresistentes que infectam gatos, indicando a necessidade de diagnóstico e tratamento precoces da pasteurelose felina devido às altas taxas de mortalidade.
